人肝癌组织及癌旁正常肝组织的mRNA差异表达谱

表1 实时PCR引物

基因	基因公共数据库号	引物5'-3'
GAPDH	NM_002046	F: GCACCGTCAAGGCTGAGAAC
		R: TGGTGAAGACGCCAGTGGA
GPC3	NM_001164617	F: CCTTTGCTGGAATGGACAAGAAC
		R: CAGCTCATGGAGATTGAACTGG
CCL20	NM_004591	F: TTGGGTGAAATATATTGTGCGTCTC
		R: TGATGTGCAAGTGAAACCTCCA
CTHRC1	NM_138455	F: GAGTCCTGGACACCCAACTACAAG
		R: AGCCGAAGTGAGCCACTGAA

表2 肝癌组织相对其正常肝组织差异性表达

改变倍数	差异性表达基因总数	上调基因数量	下调基因数量
2倍以上	1647	538	1109
5倍以上	555	227	328
10倍以上	284	94	190
20倍以上	160	43	117
50倍以上	33	15	18
100倍以上	15	7	8
总和	2694	924	1770

表3 肝癌组织相对其正常肝组织上调基因前10名

基因公共数据库号	上调倍数	基因符号	描述
NM_024780	249.31	TMC5	人类跨膜通道-5, 转录本3, mRNA
NR_024418	183.46	LOC389332	人类非典型通路389332, 非编码mRNA
NM_001958	158.38	EEF1A2	人类真核·译延伸因子1α2, mRNA
NM_005980	127.23	S100P	人类S100钙结合蛋白P, mRNA
NM_006183	119.47	NTS	人类神3/4降压素, mRNA
NM_004181	103.23	UCHL1	人类泛素末端羧基酯酶L1, mRNA
NM_001080494	94.24	TTC39A	人类肽重复序列结构域39A, 转录本2, mRNA
NM_152997	93.56	C4orf7	人类染色体4开放阅读框架7, mRNA
NM_006142	89.26	SFN	人类分层蛋白, mRNA
NM_020647	86.98	JPH1	人类亲联蛋白, mRNA

表4 肝癌组织相对其正常肝组织下调基因前10名

基因公共数据库号	下调倍数	基因符号	描述
NM_000693	878.02	ALDH1A3	人类醛脱氢酶1家族A3成员, mRNA
NR_039975	304.52	LOC100506229	人类非典型通路100506229, 转录本1, 非编码RNA
NM_013267	287.93	GLS2	人类谷氨酰胺酶2, mRNA
NM_001144904	195.67	CLEC4M	人类C型凝集域4家族M成员, 转录本2, mRNA
NM_152338	183.42	ZG16	人类酶Ô颗粒蛋白16同系物, mRNA
NM_057157	132.69	CYP26A1	人类细胞色素P450 26家族A亚科1肽, 转录本2, mRNA
NM_022820	104.75	CYP3A43	人类细胞色素P450 3家族A亚科43肽, 转录本1, mRNA
NM_176782	101.39	FAM151A	人类相似序列151家族A成员, mRNA
NM_152722	96.31	HEPACAM	人类肝细胞和胶质细胞黏附分子, mRNA
NM_004108	93.07	FCN2	人类无花果酶2, 转录本SV0, mRNA

表5 Wnt信号通路基因改变

基因公共数据库号	基因标记	改变倍数	上调/下调	描述
NM_003508	FZD9	2.21	下调	卷曲家族受体9
NM_006238	PPARD	2.38	上调	激活型受体δ
NM_002739	PRKCG	2.47	下调	蛋白激酶C
NR_028062	PRKY	2.63	上调	蛋白激酶Y关联基因
NM_001198531	TCF7L2	3.12	下调	转录因子7-2
NM_005052	RAC3	3.42	下调	C3相关ras基因
NM_001198531	TCF7	3.62	下调	转录因子7
ENST00000394822	PPP3CB	3.94	上调	蛋白磷酸酶3
NM_003506	FZD6	4.84	上调	卷曲家族受体6
NM_172082	CAMK2B	4.99	下调	钙依赖型蛋白激酶2
NM_002752	MAPK9	6.75	上调	蛋白激酶9
NM_016269	LEF1	8.96	上调	淋巴结核因子1
NM_003014	SFRP4	14.41	上调	分泌型蛋白4
NM_014420	DKK4	16.91	下调	一直同族体4
NM_003015	SFRP5	54.29	下调	分泌型蛋白5

表6 JAK-STAT信号通路基因改变

基因公共数据库号	基因标记	改变倍数	上调/下调	描述
NM_005465	AKT3	2.23	上调	蛋白激酶B
NM_001206866	IL6R	2.39	下调	白介素6受体
NM_152594	SPRED1	2.42	上调	包º域1
NM_001559	IL12RB2	2.58	下调	白介素12受体
NM_181523	PIK3R1	2.61	下调	调节亚基1
NM_000163	GHR	2.72	下调	生长因子受体
NM_001330	CTF1	3.21	下调	营养液1
NM_173065	IL28RA	4.79	下调	白介素28受体
NM_172200	IL15RA	6.25	上调	白介素15受体
NM_000600	IL6	7.56	下调	白介素6
NM_001003679	LEPR	13.38	下调	瘦素受体
NM_172249	CSF2RA	13.66	上调	集落刺激因子受体
NM_144717	IL20RB	21.09	下调	白介素20受体