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世界华人消化杂志. 2014-11-08; 22(31): 4734-4744
Published online 2014-11-08. doi: 10.11569/wcjd.v22.i31.4734
Published online 2014-11-08. doi: 10.11569/wcjd.v22.i31.4734
人肝癌组织及癌旁正常肝组织的mRNA差异表达谱
高冰, 宁淑芳, 唐艳萍, 刘海洲, 利基林, 张力图, 广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部 广西壮族自治区南宁市 530021
高冰, 在读硕士, 主要从事肝癌相关mRNA的研究.
基金项目: 广西科学研究与技术开发计划基金资助项目, No. 桂科攻1355005-3-10; 2012广西医科大学青年科学基金资助项目, No. GXMUYSF201215; Supported by: Guangxi Scientific Research and Technical Development Program, No. 1355005-3-10; and the Youth Science Foundation of Guangxi Medical University, No. GXMUYSF201215
作者贡献分布: 此课题由张力图设计; 研究过程由高冰、宁淑芳及唐艳萍操作完成; 文献检索数据分析由刘海州与利基林完成; 本论文写作由高冰完成.
通讯作者: 张力图, 主任技师, 530021, 广西壮族自治区南宁市河堤路71号, 广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部. zhanglitu@gmail.com
电话: 0771-5310593
收稿日期: 2014-08-06
修回日期: 2014-09-04
接受日期: 2014-09-17
在线出版日期: 2014-11-08
修回日期: 2014-09-04
接受日期: 2014-09-17
在线出版日期: 2014-11-08
Abstract
目的: 筛选人肝癌组织及癌旁正常肝组织差异性表达的mRNA并作生物信息学分析.
方法: 运用Agilent 8×60 K基因芯片技术检测肝癌组织及癌旁正常肝组织的基因表达谱, 用生物信息学方法进行差异基因分析及GO Pathway分析, 并用Real-time PCR验证芯片结果.
结果: 与正常肝组织相比, 肝癌组织差异性表达的基因共有2694个, 其中上调基因有924个, 下调基因有1770个. GO Pathway分析提示差异性表达基因参与转录过程、氧化还原、信号转导、离子转运、免疫应答、细胞黏附及结合功能等过程. 实时PCR验证结果提示与芯片检测结果具有较好的一致性.
结论: 基因芯片筛选出的差异性表达mRNA可能参与信号转导, 免疫应答等诸多关键环节, 为肝癌相关特异性标记的靶向治疗提供新的思路.
Keywords: 肝癌; mRNA差异性表达; 基因芯片
核心提示: 我们利用基因芯片筛选出人肝癌组织与癌旁正常肝组织的差异性表达基因共有2694个, 其中上调基因有924个, 下调基因有1770, 差异性表达mRNA可能参与信号转导, 免疫应答等诸多关键环节, 为肝癌相关特异性标记的靶向治疗提供新的思路.