基础研究
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世界华人消化杂志. 2011-12-18; 19(35): 3562-3567
在线出版 2011-12-18. doi: 10.11569/wcjd.v19.i35.3562
表1 QMSP所需的引物和探针序列
基因QMSP所需引物及探针序列 (5'-3')
Runx3[9]Forward PrimerCGTTCGATGGTGGACGTGT
Reverse PrimerGACGAACAACGTCTTATTACAACGC
ProbeFAM-CGCACGAACTCGCCTACGTAATCCG-TAMRA
β-Actin[10]Forward PrimerTGGTGATGGAGGAGGTTTAGTAAGT
Reverse PrimerAACCAATAAAACCTACTCCTCCCTTAA
ProbeFAM-ACCACCACCCAACACACAATAACAAACACA-TAMRA
表2 Runx3及β-Actin基因RT-PCR所需引物序列及反应条件
基因Forward Primer(5'-3')Reverse Primer(5'-3')产物大小(bp)退火温度(℃)循环数
Runx3[11]CAGAAGCTGGAGGACCAGACTCGGAGAATGGGTTCAGTTC1795235
β-Actin[12]TGGCACCCAGCACAATGAACTAAGTCATAGTCCGCCTAGAAGCA1865235
表3 各组细胞甲基化水平的相对定量结果
分组Ct(Runx3)Ct(β-Actin)△Ct△△Ct2-△△Ct
对照组31.28±0.1830.40±0.200.8801
5-Aza-dC组31.35±0.2329.96±0.141.390.510.70
TSA组31.68±0.1230.13±0.251.550.670.63
5-Aza-dC + TSA组31.63±0.2729.31±0.192.321.440.37

引文著录: 方中良, 沈干, 胡世莲, 孙玉蓓, 徐维平, 黄大兵, 姜晓东, 王海, 黄毕林. 5-Aza-dC及TSA对人胃癌细胞株SGC-7901 Runx3基因甲基化及表达水平的影响. 世界华人消化杂志 2011; 19(35): 3562-3567