野生型K-ras2诱导结肠癌细胞基因表达谱改变的特征分析

表1 表达水平上调基因

基因名称	染色体定位	生物学功能	Cy5/Cy3
NDP	Xp11.4	细胞间信号传导; 信号转导; 神经系统发育	4.509908
SSX4	Xp11.23	转录调控; 免疫反应	4.044489
CASP1	11q23	I-kappaB kinase/NF-kappaB级联反应的正性调节; 信号转导; 诱导凋亡	3.754063
HPRT1	Xq26.1	细胞溶解; 淋巴细胞增殖; 嘌呤核苷酸的生物合成	3.715372
TM4SF2	Xp11.4	细胞外成分	3.554822
DXS1283E	Xp22.3	未知	3.418780
DPYS	8q22	神经系统发育; 信号转导; 核苷酸代谢	3.386352
TYRP1	9p23	细胞代谢; 黑色素的生物合成	3.358984
CADPS	3p21.1	钙离子调节的胞外分泌	3.238552
MCF2	Xq27	细胞骨架	3.187850
COL4A6	Xq22	细胞外基质结构及其生物合成	3.201434
F13A1	6p25.3-p24.3	转录调控	3.108515
HTR2C	Xq24	磷酸肌醇介导的信号通路	3.061756
IL13RA1	Xq24	细胞外成分	3.050762
OGT	Xq13	信号转导	3.030588
TOSO	1q32.1	防御反应; 抗细胞凋亡	2.994371
MAB21L1	13q13	细胞增殖的正性调节; 视觉发育	2.990440
CYBB	Xp21.1	细胞间信号传导; 趋化作用; 炎症反应; 信号转导	2.972307
STK9/CDKL5	Xp22	微管骨架结构及其生物合成; 形态发生	2.946810
PTPRG	3p21-p14	蛋白酪氨酸激酶信号通路	2.878286
ELAVL2	9p21	转录调控	2.853002
GLA	Xq22	破骨细胞分化的调节; 骨吸收的调节; 细胞黏附	2.851204
APXL	Xp22.3	钠离子通道蛋白	2.839223
SERPINA7	Xq22.2	细胞外成分; 甲状性腺激素转运	2.833390

表2 表达水平显著下调基因

基因名称	染色体定位	生物学功能	Cy5/Cy3
SZF1	3p21	转录调控	0.181889
MMP14	14q11-q12	内切酶活性; 蛋白水解	0.186609
WIT-1	11p13	细胞增殖	0.189588
LOC253012	7q21.3	呼吸道气体交换; 细胞黏附; 早期神经分化和轴突生成	0.201998
OPCML	11q25	细胞黏附; 神经元识别	0.239285
PLAU	10q24	趋化作用; 蛋白质水解; 信号转换	0.258662
MYC	8q24.12-q24.13	细胞增殖正性调控; 细胞周期阻滞; 铁离子平衡; 信使核糖核	0.274307
		酸合成的调控
SNTB1	8q23-q24	肌肉收缩; 骨架和基质间黏附	0.281322
SERPINE1	7q21.3-q22	丝氨酸内切酶抑制剂; 细胞成分; 血管生成调节	0.290852
SLC20A1	2q11-q14	磷酸盐转运; 细胞构成	0.294420
SPTBN1	2p21	细胞骨架	0.298815
GNAS	20q13.2-q13.3	能量代谢; G蛋白耦联受体信号通路; 信号转导	0.302942
PCOLCE	7q22	蛋白质水解; 细胞成分	0.302975
ENPP2	8q24.1	细胞运动; G蛋白耦联受体信号通路; 细胞磷酸化代谢; 水解	0.308640
		酶活性; 磷酸酶活性; 细胞转录
CDK6	7q21-q22	细胞增殖; 细胞周期; 蛋白连接	0.315290
HIST2H2BE	1q21-q23	染色体构成和合成	0.323090
ZNF137	19q13.4	细胞转录和调控; 离子束缚	0.331670
IL1B	2q14	炎症反应; 细胞增殖; 趋化作用	0.335714
IL1A	2q14	细胞凋亡; 细胞增殖; 信号转导; 趋化作用	0.343137
MTSS1	8p22	肌动蛋白骨架构成和其生物合成; 细胞黏附; 细胞运动; 蛋白	0.346133
		酪氨酸激酶信号通路; 肌肉发育; 神经系统发育; 内吞小泡
ACHE	7q22	肌肉收缩; 信号转导	0.353254
EPHB4	7q22	细胞增殖; 器官形成; 血管形成调节	0.367571
AZGP1	7q22.1	细胞膜成分	0.375540
PDE4DIP	1q12	蛋白质生成; 肌动蛋白骨架构成及生物合成	0.376983
PITPN	17p13.3	磷脂转运	0.378532
MEOX1	17q21	机体生长	0.385950
GNB2L1	5q35.3	细胞内信号级联反应; 蛋白定位; 信号转导; 蛋白激酶C活性	0.394205
MERTK	2q14.1	信号转导; 细胞间信号传导; 蛋白质磷酸化	0.405261
CUTL1	7q22.1	转录调控	0.419088
FCGR2A	1q23	免疫反应; 信号转换; 防御反应; B细胞增殖的负调节	0.428152
PAX8	2q12-q14	器官形成; 细胞转录和调控; 后肾发育; 信使核糖核酸合成的调控	0.442376

表3 差异表达基因功能分类

基因类别	下调基因(个)	占总下调基因比率(％)	上调基因(个)	占总上调基因比率(％)
代谢相关	18	14.88	3	12.50
细胞增殖	30	24.79	3	12.50
细胞周期	16	13.22	0	0
信号转导	18	14.88	8	33.3
细胞骨架	8	6.61	1	4.17
转录调控	18	14.88	4	16.67
细胞黏附	11	9.09	1	4.17
细胞凋亡	8	6.61	2	8.33
细胞分化	14	11.57	4	16.67
免疫相关	14	11.57	2	8.33
胞外基质	6	4.96	1	4.17