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©The Author(s) 2004.
世界华人消化杂志. 2004-09-15; 12(9): 2086-2090
在线出版 2004-09-15. doi: 10.11569/wcjd.v12.i9.2086
在线出版 2004-09-15. doi: 10.11569/wcjd.v12.i9.2086
表1 PCR-RFLP分析TNF-α基因启动子多态性的引物及限制性内切酶条件
位点 | 引物序列 | 扩增片段长度 | 限制性内切酶 | 酶切温度 | 酶切时间 |
-238G/A | P1: 5'-AGAAGACCCCCCTCGGAACC-3' | 152 bp | MspI | 37 ℃ | 3 h |
P2: 5'-ATCTGGAGGAAGCGGTAGTG-3' | |||||
-308G/A | P1: 5'-AGGCAATAGGTTTTGAGGGCCAT-3' | 116 bp | NcoI | 37 ℃ | 1.5 h |
P2: 5'-ACACTCCCCATCCTCCCTGCT-3' | |||||
-857C/T | P1: 5'-GGCTCTGAGGAATGGGTTAC-3' | 129 bp | TaiI | 65 ℃ | 3 h |
P2: 5'-CCTCTACATGGCCCTGTCTAC-3' | |||||
-863C/A | P1: 5'-GGCTCTGAGGAATGGGTTAC-3' | 126 bp | TaiI | 65 ℃ | 3 h |
P2: 5'-CTACATGGCCCTGTCTTCGTTACG-3' |
表2 中国汉族人TNF-α基因启动子基因型分布情况
基因型1 | CHB组(n) | SR组(n) | 合计 |
GG·GG·CC·CC | 0.511(67)a | 0.327(54) | 0.409(121) |
GG·GG·CC·AA | 0.046(6) | 0.018(3) | 0.030(9) |
GG·GG·CT·CC | 0.115(15) | 0.146(24) | 0.132(39) |
GG·GG·CC·CA | 0.153(20)b | 0.273(45) | 0.220(65) |
GG·GA·CC·CC | 0.046(6)b | 0.121(20) | 0.088(26) |
GA·GG·CC·CA | 0.015(2) | 0.012(2) | 0.014(4) |
GG·GG·TT·CC | 0.023(3) | 0(0) | 0.010(3) |
GA·GG·CC·CC | 0.038(5) | 0.024(4) | 0.031(9) |
GG·GG·CT·CA | 0.053(7) | 0.061(10) | 0.057(17) |
GG·GA·CT·CA | 0(0) | 0.006(1) | 0.003(1) |
GG·GA·CC·CA | 0(0) | 0.006(1) | 0.003(1) |
GA·GG·CT·CA | 0(0) | 0.006(1) | 0.003(1) |
表3 SR组和CHB组TNF-α启动子多态性位点基因型频率比较
位点 | 基因型 | CHB组(n) | SR组(n) | χ2值 | P值 |
- 238 | GG | 0.962(126) | 0.958(158) | 0.03 | 0.854 |
GA | 0.038(5) | 0.042(7) | |||
- 308 | GG | 0.954(125) | 0.867(143) | 6.53 | 0.011 |
GA | 0.046(6) | 0.133(22) | |||
- 857 | CC | 0.809(106) | 0.782(129) | ||
CT | 0.168(22) | 0.218(36) | 4.79 | 0.091 | |
TT | 0.023(3) | 0(0) | |||
- 863 | CC | 0.733(96) | 0.618(102) | ||
CA | 0.221(29) | 0.364(60) | 8.18 | 0.017 | |
AA | 0.046(6) | 0.018(3) |
引文著录: 张平安, 李艳, 向萍霞, 吴健民. TNF-α基因启动子多态性与HBV感染转归的关系. 世界华人消化杂志 2004; 12(9): 2086-2090