基础研究
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世界华人消化杂志. 2023-06-08; 31(11): 446-455
Published online 2023-06-08. doi: 10.11569/wcjd.v31.i11.446
附子理中丸治疗肠结核作用机制的网络药理学研究
苏敏, 钱纯, 张贞, 姜思宇, 李菁, 李云豪, 周辉
苏敏, 钱纯, 张贞, 姜思宇, 李菁, 李云豪, 周辉, 湖南中医药大学第一附属医院医学检验中心 湖南省长沙市 410000
苏敏, 主管技师, 研究方向为消化疾病医学检验.
基金项目: 湖南省教育厅优秀青年项目, No. 20B435.
作者贡献分布: 苏敏负责此次研究设计及文章撰写; 钱纯、张贞、姜思宇、李菁负责研究具体操作; 李云豪负责文章制图与排版; 周辉负责研究质控及统筹.
通讯作者: 周辉, 主管技师, 410000, 湖南省长沙市雨花区韶山中路95号, 湖南中医药大学第一附属医院医学检验中心. zyfyjianyan@163.com
收稿日期: 2023-04-18
修回日期: 2023-05-04
接受日期: 2023-05-18
在线出版日期: 2023-06-08
Abstract
背景

临床上常规结核化疗方案治疗肠结核副作用较大. 附子理中丸是一种传统的治疗肠结核的中药. 研究其具体的生物学作用机制有助于肠结核的治疗的进一步研究.

目的

基于网络药理学研究附子理中丸治疗肠结核的作用机制.

方法

在TCMSP数据库中分别筛选附子理中丸5种主要药材的有效活性成分, 并从TCMSP及Drugbank数据库中收集有效成分的作用靶点; 在Genecards数据库收集肠结核相关的疾病靶点; 通过Venny 2.1.0在线网站取药物活性成分作用靶点与疾病靶点的重叠靶点作为药物治疗肠结核的潜在治疗靶点; 使用Cytoscape 3.9.1软件构建"药物-活性成分-靶点-疾病"网络; 在String在线数据库中构建药物潜在治疗靶点的蛋白质互作(protein-protein interaction, PPI)网络, 并通过Cytoscape 3.9.1软件进行拓扑学及可视化分析, 进一步选取核心作用靶点; 使用R4.1.2软件中的"clusterProfiler"程序包对潜在药物作用靶点进行京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)富集分析和基因本体论(Gene Ontology, GO)分析.

结果

从公共数据库中一共收集了附子理中丸活性药物成分共108种, 药物作用靶点254个, 疾病靶点2579个; 筛选出的药物潜在治疗靶点一共134个, 核心靶点10个(AKT1、IL-6、TP53、VEGFA、IL1B、JUN、CASP3、PTGS2、PPARG、MAPK3); GO和KEGG富集分析提示附子理中丸治疗肠结核的生物学机制可能与细胞氧化应激、细胞因子参与的免疫调节相关, 可能参与的功能通路包括白介素17信号通路、氧化应激通路等.

结论

附子理中丸治疗肠结核的作用机制与氧化应激、细胞因子参与的炎症或免疫调节相关, 为日后的临床或基础研究提供了研究方向.

Keywords: 肠结核; 附子理中丸; 网络药理学; 细胞因子

核心提要: 本研究基于网络药理学分析, 构建了附子理中丸与肠结核蛋白互作网络, 并筛选出附子理中丸作用于肠结核的10个核心靶点, 通过京都基因和基因组百科全书富集分析和基因本体论分析发现了治疗作用机制与氧化应激、细胞因子参与的炎症或免疫调节相关.