临床研究
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世界华人消化杂志. 2021-09-28; 29(18): 1055-1063
Published online 2021-09-28. doi: 10.11569/wcjd.v29.i18.1055
基于生物信息学分析PDE2A基因在消化系统肿瘤预后及免疫浸润的临床意义
张钊熊, 韩强, 刘树业
张钊熊, 刘树业, 天津市第三中心医院检验科, 天津市重症疾病体外生命支持重点实验室, 天津市人工细胞工程技术研究中心, 天津市肝胆疾病研究所 天津市300170
张钊熊, 博士, 主要从事肝癌的基础与临床研究.
韩强, 中国医科大学基础医学院及附属第一医院病理科 辽宁省沈阳市 110000
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 81902986.
作者贡献分布: 此课题由刘树业与张钊熊设计; 研究过程由张钊熊与韩强完成; 数据分析由张钊熊与韩强完成; 论文写作由张钊熊与刘树业完成.
通讯作者: 刘树业, 教授, 300170, 天津市河东区津塘路83号, 天津市第三中心医院检验科. lshye@163.com
收稿日期: 2021-05-11
修回日期: 2021-06-07
接受日期: 2021-06-20
在线出版日期: 2021-09-28
Abstract
背景

消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一, 然而其预后仍不好. 探索潜在生物标志物是肿瘤研究的重要方向. 我们拟利用生物信息学方法探索消化系统的潜在标志物.

目的

探究在消化系统肿瘤中PDE2A表达与免疫浸润相关性, 探索PDE2A在消化系统肿瘤中的预后价值.

方法

通过HPA、TIMER和UALCAN数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤中的mRNA及蛋白表达, 利用GEPIA数据库探索PDE2A在不同消化系统肿瘤患者预后的影响. 通过TIMER数据库探索PDE2A表达与不同消化系统肿瘤免疫浸润相关性. 利用cBioPortal数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤的遗传突变信息. 通过STRING数据库探索PDE2A的潜在蛋白相互作用网络.

结果

PDE2A基因mRNA和蛋白在肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌组织中表达低于正常癌旁组织. PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者较PDE2A低表达的患者预后良好. PDE2A表达与肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌不同免疫细胞如CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、B细胞、巨噬细胞和中性粒细胞呈正相关或负相关. PDE2A基因在胃癌、胰腺癌、结肠癌及食管癌中存在错义突变等遗传改变.

结论

PDE2A表达与消化系统肿瘤免疫浸润有关. PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者预后良好. PDE2A基因可能为潜在的消化系统肿瘤免疫治疗靶点和预后标志物.

Keywords: 消化系统肿瘤; 免疫浸润; 预后; PDE2A; 生物信息学

核心提要: PDE2A表达与消化系统肿瘤免疫浸润有关. PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者预后良好. PDE2A基因可能为潜在的消化系统肿瘤免疫治疗靶点和预后标志物.