修回日期: 2020-06-27
接受日期: 2020-07-15
在线出版日期: 2020-08-28
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是临床上常见的实体恶性肿瘤, 预后较差. 本文拟采用生物信息学技术分析PPP1R105基因在肝细胞癌中的表达相关信号通路及其与患者预后关系. 同时, 采用免疫组织化学法对PPP1R105生物信息数据进行验证.
探讨PPP1R10基因(Ki-67或MKI67)在HCC中的表达及其临床意义.
在TCGA数据中, 检索PPP1R105基因在各个肿瘤组织中的相对表达情况; 分析PPP1R105基因在肝细胞癌组织和癌旁组织中的相对表达水平, 并比较是否存在差异. 应用蛋白相互作用数据库STRING构建PPP1R105基因编码蛋白相互作用网络. 比较PPP1R105高低表达组患者无疾病进展生存(disease free survival, DFS)和总生存(overall survival, OS)是否存在差异. 选取我院手术治疗的原发性肝细胞癌患者81例进行回顾性分析, 采用免疫组织化学法检测肝细胞癌组织中PPP1R105蛋白表达情况, 并与患者的临床特征进行相关性分析.
PPP1R105基因mRNA在不同肿瘤中表达水平差异并不显著, 其表达不具备肿瘤间特异性. 在肝细胞癌中, 癌组织PPP1R105mRNA表达水平显著高于癌旁正常肝组织(P<0.05), 且表达水平与患者临床分期有关(P<0.05). 蛋白相互作用网络区域聚集指数为0.99, 蛋白相互作用网络富集明显(P<0.01). PPP1R105及其相关基因信号通路主要富集于细胞周期、细胞衰老、病毒致癌及p53信号通路. KIF18B与PPP1R105正相关表达最为显著(rpearson = 0.91, P<0.05); 而MCELL基因与PPP1R105负相关表达最为显著(rpearson = -0.59, P<0.05); PPP1R105高表达组OS (HR = 1.90, P<0.01)和DFS(HR = 1.90, P<0.01)显著低于低表达组. PPP1R105蛋白主要表达于细胞核质及核仁, 81例患者中高表达者30例(37.0%). PPP1R105蛋白高表达患者肿瘤大于5 cm及TNM分期Ⅲa期患者比例显著高于MIK67蛋白低表达者(P<0.05).
肝细胞癌患者PPP1R105高表达, 其与患者总生存和无疾病进展生存较短有关, 可作为肝细胞癌患者预后不良分子标志物.
核心提要: PPP1R105基因mRNA在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)组织中表达水明显上调, 其信号通路主要富集于细胞周期、细胞衰老、病毒致癌及p53. PPP1R105高表达组无疾病进展生存和总生存显著低于低表达组. PPP1R105高表达可能是HCC患者预后不良的危险因素.