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COL6A3基因在胃癌中的表达及临床意义
韩一帆, 朱少俊, 温州医科大学附属第二医院普通外科 浙江省温州市 325000
韩一帆, 住院医师, 主要从事肠道免疫及肠道益生菌等相关研究.
作者贡献分布: 此课题由韩一帆与朱少俊设计; 研究过程由韩一帆与朱少俊操作完成; 研究所用分析工具由韩一帆与朱少俊提供; 数据分析由韩一帆与朱少俊完成; 本论文写作由韩一帆与朱少俊完成.
通讯作者: 朱少俊, 主任医师, 325000, 浙江省温州市学院西路109号, 温州医科大学附属第二医院普通外科. hansjwzmu@163.com
电话: 0577-88721778
收稿日期: 2018-12-25
修回日期: 2019-01-17
接受日期: 2019-02-24
在线出版日期: 2019-03-08
修回日期: 2019-01-17
接受日期: 2019-02-24
在线出版日期: 2019-03-08
Abstract
背景
从分子水平探析胃癌(gastric cancer, GC)病理机制对改善患者预后至关重要. 目前, COL6A3在GC中的表达情况及临床意义鲜有报道.
目的
研究COL6A3基因在GC中的表达情况和临床意义, 并探究可能的作用机制.
方法
收集GC相关生物大数据, 对肿瘤样本的基因表达谱数据及其对应的临床信息进行回顾性分析和生存分析; 采用基因集富集分析方法探讨COL6A3在GC中可能的作用机制.
结果
COL6A3在GC中表达明显升高(P<0.0001), 且具有较大诊断价值(AUC = 0.9516). COL6A3高表达与T分期显著相关(P = 0.001), COL6A3高表达的GC浸润深度更大. COL6A3高表达患者的预后明显差于低表达患者(P = 0.0018). COL6A3高表达样本中, 富集了多个肿瘤相关通路的基因集(n = 68).
结论
COL6A3高表达与GC的发生发展相关, 具有较大的临床意义.
Keywords: 胃癌; COL6A3; 表达水平; 临床意义
核心提要: 本文利用大数据分析的方法, 系统分析了COL6A3表达在胃癌(gastric cancer, GC)中的临床意义, 提示COL6A3在GC中可能是一种可靠的生物标志物. 同时, 本文所使用的研究方法, 也为其它疾病中生物标志物的挖掘提供了借鉴.