临床研究
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世界华人消化杂志. 2019-12-28; 27(24): 1490-1501
Published online 2019-12-28. doi: 10.11569/wcjd.v27.i24.1490
CCNA2基因在肝细胞癌中的表达、信号通路和预后关系生物信息分析及验证
杨结, 刘树业, 刘运德
杨结, 刘树业, 天津医科大学三中心临床学院检验科, 天津市肝胆疾病研究所, 天津市人工细胞重点实验室, 卫生部人工细胞工程技术研究中心 天津市 300170
杨结, 中级检验技师, 主要从事肝癌临床检验研究.
刘运德, 天津医科大学医学检验学院 天津市 300170
作者贡献分布: 此论文由刘运德与杨结设计; 研究由杨结与刘树业合作完成; 生物信息学数据分析由杨结和刘运德完成; 论文撰写由杨结和刘运德完成.
通讯作者: 刘运德, 教授, 主任医师, 300170, 天津市气象台路22号, 天津医科大学医学检验学院. yundeliu@126.com
电话: 022-84112153
收稿日期: 2019-10-31
修回日期: 2019-12-10
接受日期: 2019-12-20
在线出版日期: 2019-12-28
Abstract
背景

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是消化系统常见恶性肿瘤, 预后较差. 本文拟采用生物信息学方法探讨CCNA2基因在HCC中的表达情况, 及其作为HCC患者预后分子标志物的可行性. 同时, 采用免疫组织化学法对CCNA2生物信息分析结果进行验证.

目的

探讨CCNA2在HCC中的表达, 相关信号通路及与患者预后关系.

方法

应用生物信息分析工具比对TCGA数据库中CCNA2基因mRNA在HCC组织和癌旁组织中表达水平; 在STRING数据库中构建CCNA2蛋白-蛋白相互作用网络, 并对相关蛋白功能和KEGG信号通路进行富集. 根据CCNA2表达水平分为高低表达组, 比较CCNA2高低组患者总生存(overall survival, OS)和无疾病进展生存(disease free survival, DFS)是否不同. 回顾性分析72例手术治疗的HCC患者, 采用免疫组织化学法检测患者癌组织中CCNA2蛋白表达水平与患者临床病理特征的关系, 对生物信息分析结果进行验证.

结果

在HCC中, CCNA2中mRNA表达水平明显高于癌旁正常肝组织; 与CCNA2蛋白相互作用较为紧密的蛋白10个, 蛋白间相互作用关系edge = 50, 区域聚类指数为0.931, 与CCNA2蛋白相互作用较为紧密的10蛋白相互作用网络富集显著(P<0.05); TOP2基因mRNA与CCNA2正向相关表达(r = 0.85, P<0.05), 而CCL14基因与CCNA2负相关表达(r = -0.54, P<0.05). CCNA2基因相关信号通路主要富集于细胞周期、病毒致癌、乙型肝炎、p53信号通路和PI3K-Akt信号通路等. 预后分析提示CCNA2基因mRNA高表达患者OS(HR = 1.7, P = 0.0037)和DFS低于低表达组(HR = 1.6, P = 0.0037). 免疫组化显示CCNA2蛋白在HCC患者癌组织中的高表达率为34.7%(25/72). CCNA2蛋白高表达与HCC患者肿瘤直径(P<0.05)、DC浸润(P<0.05)、术后2年复发/转移(P<0.05)有关.

结论

CCNA2基因在HCC患者癌组织中表达水平上调, 并可作为HCC预后不良的分子标记物.

Keywords: 肝细胞癌; TCGA数据库; CCNA2基因; 信号通路; 预后

核心提要:CCNA2基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)患者癌组织中表达水平显著高于癌旁正常组织, CCNA2蛋白高表达与HCC患者肿瘤直径(P<0.05)、DC浸润(P<0.05)、术后2年复发/转移(P<0.05)和预后不良有关. CCNA2高表达可作为HCC预后不良的分子标志物.