Published online 2019-10-08. doi: 10.11569/wcjd.v27.i19.1193
修回日期: 2019-09-09
接受日期: 2019-09-18
在线出版日期: 2019-10-08
胃癌(gastric cancer, GC)是癌症相关死亡的重要原因, 也是消化系统最为常见的肿瘤. 然而, GC预后相关因素并不完全清楚. 本文从生物信息角度探讨GC预后的分子标志物.
探讨应用Oncomie和Kaplan-Meier Plotter数据平台分析跨膜丝氨酸蛋白酶4(transmembrane protease serines 4, TMPRSS4)在GC组织与正常胃组织中的差异表达及与患者生存期的关系.
深入挖掘Oncomie和Kaplan-Meier Plotter数据平台中TMPRSS4基因表达与GC相关性数据集, 并应用在线分析软件比较癌组织和正常胃组织TMPRSS4基因mRNA表达水平是否存在差异. 绘制生存曲线比较TMPRSS4高低表达患者生存期是否存在差异, 探讨TMPRSS4作为GC患者预后分子标记物的可行性. 同时, 回顾性分析手术治疗的50例GC患者的临床资料, 采用免疫组织化学法检测50例患者癌组织中TMPRSS4蛋白的表达情况, 并分析TMPRSS4表达与患者临床特征是否存在相关性.
Oncomine数据库中共收录了GC、乳腺癌等常见肿瘤组织与对应正常组织中TMPRSS4基因差别表达的相关数据集共185项, 其中存在差异表达10项, 有9项在肿瘤组织中高表达, 有1项在肿瘤组织中低表达. 通过聚类层次聚类分析显示, TMPRSS4基因在GC中呈现共表达的基因有LAMB3, LAD1, ANXA4等. TMPRSS4与LAMB3, LAD1, ANXA4的共表达相关系数分别为0.57, 0.51和0.43. Oncomine数据库中, 有2项基因表达芯片数据关于TMPRSS4基因在GC组织与正常组织中差异表达的研究, 2项基因表达芯片结果均提示在GC组织中, TMPRSS4表达水平高于正常胃组织(P<0.05). Kaplan-Meier Plotter分析显示TMPRSS4高低表达组总中位生存时间分别为22.0 mo和32.6 mo, 高表达组显著低于低表达组(HR = 1.31, 95%CI: 1.09-1.57, P<0.05). 高低表达组中位无疾病进展生存时间分别为22.40 mo和13.87 mo, 高表达组显著低于低表达组(HR = 1.27, 95%CI: 1.03-1.58, P<0.05). 免疫组化显示TMPRSS4阳性表达与患者肿瘤是否侵犯血管存现相关性, TMPRSS4阳性患者肿瘤侵犯血管比显著高于阴性者(P<0.05).
与正常胃组织比较, GC组织中TMPRSS4基因mRNA表达水平明显上调, 其高表达与患者的预后不良相关, 且高表达者肿瘤侵犯血管比例较高.
核心提要: 本研究通过分析Oncomie和Kaplan-Meier Plotter等数据库, 采用生物信息学方法探讨TMPRSS4在胃癌(gastric cancer, GC)中的表达及其作为预后分子标志物的可信性. 同时采用免疫组化对生物信息分析结果进行证实. 研究结果提示TMPRSS4在GC中高表达并与GC患者预后不良有关, 可作为GC预后相关分子标志物.