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世界华人消化杂志. 2016-09-18; 24(26): 3779-3789
Published online 2016-09-18. doi: 10.11569/wcjd.v24.i26.3779
Published online 2016-09-18. doi: 10.11569/wcjd.v24.i26.3779
青海地区乙型肝炎感染者C/D基因型重组分布
黄维金, 辜文洁, 王佑春, 卫生部生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室 北京市 100050
黄维金, 辜文洁, 王佑春, 中国食品药品检定研究院 北京市 100050
黄维金, 副研究员, 主要从事HBV、HIV诊断试剂和HIV及HPV疫苗的质量标准方面的研究.
作者贡献分布: 黄维金负责课题设计、基因分型检测和序列测定、文献查找、数据分析及论文撰写工作; 辜文洁负责血清学检测与基因型检测; 王佑春负责课题设计、数据分析及论文撰写.
基金项目: 十二五传染病重大专项课题基金资助项目 , No. 2012ZX10004701 .
通讯作者: 王佑春, 研究员, 100050, 北京市天坛西里2号, 中国食品药品检定研究院. wangyc@nifdc.org.cn
电话: 010-67095921
收稿日期: 2016-05-20
修回日期: 2016-07-15
接受日期: 2016-07-31
在线出版日期: 2016-09-18
修回日期: 2016-07-15
接受日期: 2016-07-31
在线出版日期: 2016-09-18
Abstract
目的
区分D基因型重组类型, 了解青海地区乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)感染者C/D基因型重组情况.
方法
收集217份青海地区慢性乙型肝炎感染者样品, PCR扩增535-1460 nt和1779-2400 nt 2个片段的乙型肝炎病毒基因序列, 分2区(593-799 nt、799-1450 nt和1799-2400 nt)构建进化树, 确定青海地区HBV基因重组类型. 利用 INNO-LiPA HBV分型试剂检测青海地区的C/D基因型重组样品, 计算符合率.
结果
青海地区利用HBV不同区域进化树分型, 结果显示各基因型比例为CD1(61.9%)、CD2(8.4%)、C(27.0%)和B(2.8%). 基因型分布在藏族和汉族乙型肝炎感染者中的差异具有显著的统计学意义(χ2 = 17.9, P<0.01), 藏族乙型肝炎感染者中C/D基因型重组和C基因型比例为91.5.0%和8.5%; 在汉族中的比例为68.5%和32.3%. C/D基因型重组和C基因型HBV e抗原阴阳性的差异(χ2 = 0.28, P>0.05)以及病毒载量的差异(t = 1.125, P>0.05)均没有统计学意义. C/D重组样品INNO-LiPA分型试剂检测结果为D基因型的理论符合率为87.8%.
结论
青海地区乙型肝炎感染者以CD1(10-799 nt)基因型重组以主, 对其临床意义应进一步的研究分析. 该地区的HBV分型检测应注意基因重组对分型试剂的影响.
Keywords: 乙型肝炎病毒; 基因型; 重组
核心提要: 青海地区乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)基因型以CD基因型重组为主, 且存在两种重组类型, 在该地区藏族和汉族HBV感染者中的分布也具有显著的差异.