基础研究
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世界华人消化杂志. 2015-04-28; 23(12): 1873-1882
Published online 2015-04-28. doi: 10.11569/wcjd.v23.i12.1873
以iTRAQ技术分析大鼠肝纤维化发展成肝癌过程中肝组织差异表达的蛋白质
付娆, 张学荣, 廖明, 付道莹
付娆, 张学荣, 廖明, 付道莹, 广西医科大学医学科学实验中心 区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室 广西壮族自治区南宁市 530021
付娆, 在读硕士, 主要从事肝纤维化药物治疗及其蛋白质组学研究.
基金项目: 广西自然科学基金资助项目, No. 2013GXNSFBA019167; 广西区域性高发肿瘤防治研究(教育部)重点实验室基金资助项目, Nos. GK2013-13-A-01-03, GK2014-ZZ05.
作者贡献分布: 此课题由廖明设计; 研究过程由付娆与付道莹完成; 张学荣指导; 数据分析由付娆完成; 本论文写作由付娆完成; 廖明审校.
通讯作者: 廖明, 副研究员, 博士, 530021, 广西壮族自治区南宁市双拥路22号, 广西医科大学医学科学实验中心, 区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室. lminggx@163.com
电话: 0771-5358354
收稿日期: 2015-01-12
修回日期: 2015-03-10
接受日期: 2015-03-18
在线出版日期: 2015-04-28
Abstract

目的: 分析大鼠肝纤维化发展成为肝癌过程中肝组织差异表达的蛋白, 以寻找其发展过程中的关键蛋白.

方法: 以二乙基亚硝胺(diethylinitrosamine, DEN)建立大鼠肝纤维化-肝癌模型, 采用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术结合2D-LC-MS/MS(two dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry)定量蛋白质组学技术, 分析和鉴定建模过程中的第4、10、12、18周肝组织蛋白质的差异表达, 经生物信息学分析差异表达的蛋白质功能.

结果: 质谱分析共鉴定到530种蛋白质. 4个时间点鉴定到的差异蛋白质数量分别为128、113、106、127个, 均重复鉴定到的差异蛋白为49个, 其中上调蛋白37个, 下调蛋白12个. 通过对这些差异蛋白进行功能分析, 发现他们参与翻译后修饰、转录、重组和信号传导等过程.

结论: iTRAQ结合LC-ESI-MS/MS定量蛋白质组学技术能整体、动态分析的大鼠肝纤维化演变肝癌过程中的蛋白质表达变化, 其中鉴定到过氧化物还原酶1(peroxiredoxin-1, Prdx1)、过氧化物还原酶2(peroxiredoxin-2, Prdx2)、硫代硫酸硫基转移酶(thiosulfate sulfurtransferase, Tst)、真核翻译起始因子3b(eukaryotic translation initiation factor 3 subunit b, eIF3b)、α2-HS-糖蛋白(alpha-2-HS-glycoprotein, Ahsg)和超氧化物歧化酶1(superoxide dismutase 1, SOD1)蛋白可能是肝纤维化发展为肝癌过程中的关键蛋白, 值得进一步深入探讨研究.

Keywords: 肝纤维化-肝癌模型; 差异蛋白; iTRAQ

核心提示: 本文利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术筛选肝纤维化发展为肝癌过程中的差异蛋白, 分析得到的6种关键蛋白对下一步寻找肝癌早期诊断指标奠定基础.