研究快报
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世界华人消化杂志. 2015-01-08; 23(1): 78-84
Published online 2015-01-08. doi: 10.11569/wcjd.v23.i1.78
miRNA-210在胃癌转移细胞株中的表达及功能预测
张小静, 冯先玲, 黄勇, 高燕, 曹子一, 黄伟玲, 张媛, 简千贺, 钟锦成, 杨梦婷, 范新民, 金哲
张小静, 冯先玲, 范新民, 金哲, 深圳大学医学院病理教研室 深圳天然小分子创新药物工程实验室 深圳市肿瘤转化医学重点实验室 广东省深圳市 518060
黄勇, 曹子一, 黄伟玲, 张媛, 杨梦婷, 深圳大学医学院临床医学系 广东省深圳市 518060
高燕, 深圳市第六人民医院(南山医院)消化科 广东省深圳市 518060
简千贺, 钟锦成, 深圳大学医学院药学系 广东省深圳市 518060
金哲, 北京大学深圳研究生院化学基因组学重点实验室 广东省深圳市 518060
张小静, 讲师, 主要从事消化系统疾病的病理研究.
基金项目: 国家自然科学基金面上资助项目, No. 81172282; 国家自然科学基金青年基金资助项目, No. 81302151; 深圳市海外高层次人才创新创业专项基金资助项目, No. KQCX20130621101141669; 深圳市科技研发资金国家和省计划配套基金资助项目, No. GJHS20120621142654087; 深圳市肿瘤转化医学重点实验室建设基金资助项目, No. ZDSY20130329101130496; 深圳大学科研基金资助面上资助项目, No. 80100035905; 深圳大学基础研究科研基金资助项目, No. 201108; 深圳大学科技创新团队基金资助项目, No. T201202.
作者贡献分布: 张小静、冯先玲及黄勇对此文所作贡献均等; 此课题由张小静、冯先玲、黄勇、高燕、范新民及金哲设计; 研究过程由曹子一、黄伟玲、张媛、简千贺、钟锦成及杨梦婷操作完成; 研究所用试剂及分析工具由杨梦婷提供; 数据分析有张小静、冯先玲及黄勇完成; 本论文写作由张小静、范新民及金哲完成.
通讯作者: 金哲, 教授, 518060, 广东省深圳市南山区南海大道3688号, 深圳大学医学院病理教研室, 深圳天然小分子创新药物工程实验室, 深圳市肿瘤转化医学重点实验室. zhejin@szu.edu.cn
电话: 0755-86671904  传真: 0755-86671906
收稿日期: 2014-10-15
修回日期: 2014-11-14
接受日期: 2014-11-25
在线出版日期: 2015-01-08
Abstract

目的: 筛选胃癌(gastric cancer, GC)转移相关的差异表达微小RNA(microRNA, miRNA), 探讨miRNA-210与GC转移的可能机制.

方法: 应用miRNA表达谱芯片筛选GC高转移细胞株RF48及低转移细胞株RF1的差异表达miRNAs, RT-PCR检测miRNA-210在7种GC细胞株中的表达情况, 利用miRWalk软件获得miRNA-210的靶基因, 通过David在线软件(包括GO分析及KEGG通路预测)分析miR-210靶基因的可能生物学功能.

结果: 与RF1相比, miRNA芯片在RF48细胞中共筛选出21个表达上调和15个表达下调的miRNA, 其中miRNA-210在高转移细胞株RF48中的表达增高; RT-PCR结果显示miRNA-210在高转移GC细胞株中表达增高(P<0.05); miRWalk共获得155个miRNA-210靶基因; GO分析及KEGG pathway分析得到miRNA-210靶基因功能, 这些靶基因参与了肿瘤的发生、发展及转移.

结论: 利用miRNA芯片技术获得了GC转移相关miRNA表达谱; miRNA-210的异常表达可能与GC的转移有关, 为GC转移的早期诊断及发现新的治疗靶点奠定了基础.

Keywords: 胃肿瘤; miRNA-210; 微阵列分析; 肿瘤转移; 计算生物学

核心提示: 本文利用微小RNA(microRNA, miRNA)芯片技术获得了胃癌(gastric cancer, GC)转移相关miRNA表达谱; miRNA-210的异常表达可能与GC的转移有关, 为GC转移的早期诊断及发现新的治疗靶点奠定了基础.