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广西地区丙型肝炎病毒的基因型分布与流行病学特征
唐维, 苏明华, 江建宁, 刘志红, 韦智, 晏双龙, 滕春玲, 广西医科大学第一附属医院感染性疾病科 广西壮族自治区南宁市 530021
覃锦耀, 广西医科大学第一附属医院检验科 广西壮族自治区南宁市 530021
唐维, 在读硕士, 主要从事与慢性丙型肝炎疾病进展相关因素的研究.
基金项目: 广西卫生厅基金资助项目, No. Z2011346.
作者贡献分布: 此课题由唐维、苏明华及江建宁设计; 研究过程、资料查找及数据分析由唐维、刘志红、韦智及晏双龙共同完成; 实验样本由覃锦耀与滕春玲收集; 论文撰写由唐维完成; 苏明华审校.
通讯作者: 苏明华, 教授, 主任医师, 530021, 广西壮族自治区南宁市双拥路6号, 广西医科大学第一附属医院感染性疾病科. smh9292@163.com
电话: 0771-5356531
收稿日期: 2013-12-27
修回日期: 2014-01-24
接受日期: 2014-02-03
在线出版日期: 2014-03-28
修回日期: 2014-01-24
接受日期: 2014-02-03
在线出版日期: 2014-03-28
Abstract
目的: 了解广西地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)基因型的分布特征, 探讨HCV基因型与民族、性别、年龄、感染途径及HCV RNA载量的关系.
方法: 收集广西地区137例HCV RNA阳性患者的血清样本, 采用逆转录巢式PCR(RT nested-PCR)法扩增HCV NS5B区段, 对PCR终产物纯化测序后与Genbank中的标准株全基因序列比对, 共同构建HCV NS5B区段系统进化树.
结果: 广西地区HCV基因型主要为1b型(58.4%), 其次是6a型(12.4%), 3b型(10.2%), 1a型(7.3%), 2a型(7.3%), 3a型(4.4%). 分析表明, HCV基因型与民族、性别无明显相关性(P>0.05), 而与年龄、感染途径及HCV-RNA载量有一定相关性(P<0.05).
结论: 构建HCV NS5B区段系统进化树能得到准确的HCV基因型和亚型; 广西地区至少存在7种HCV基因亚型, 以1b型为主, 6a型和3b型次之; 较国内早期的研究报道, 1b型的流行率似乎有下降趋势, 而6a型的流行率似乎逐步上升; 3型与6a型多见于有静脉药瘾史的年轻患者; 随着感染途径的变迁, HCV基因型的分布也将发生改变.
Keywords: 广西地区; 丙型肝炎病毒; 基因型; 系统进化树; 相关因素
核心提示: 广西地区目前至少存在7种丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)基因亚型(1a、1b、2a、3a、3b、6a、6d), 由于地处西南边境, 近年来吸毒人群不断增多, 静脉吸毒有可能成为广西地区新发HCV感染的主要传播途径, 且吸毒人群流动性大, 各地区的HCV基因型分布也将发生变化.