临床经验
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世界华人消化杂志. 2014-08-28; 22(24): 3675-3680
Published online 2014-08-28. doi: 10.11569/wcjd.v22.i24.3675
使用GEO数据集分析PFKFB3在肝细胞癌中的表达及临床意义
丁千山, 孙荣泽, 王笑臣, 沈世强
丁千山, 孙荣泽, 王笑臣, 沈世强, 武汉大学人民医院肝胆腔镜外科 湖北省武汉市 430066
丁千山, 在读博士, 主要从事消化系肿瘤的研究.
作者贡献分布: 此课题由丁千山设计; 数据分析与文章书写由丁千山、孙荣泽及王笑臣共同完成; 文章指导与审阅由沈世强完成.
通讯作者: 沈世强, 教授, 主任医师, 430066, 湖北省武汉市武昌区张之洞路95号, 武汉大学人民医院肝胆腔镜外科. swsw2218@hotmail.com
收稿日期: 2014-05-14
修回日期: 2014-07-11
接受日期: 2014-07-28
在线出版日期: 2014-08-28
Abstract

目的: 通过基因表达汇编(Gene Expression Omnibus, GEO)公共数据库, 探讨6-磷酸果糖激酶2(6-phosphofructo-2-kinase, PFKFB3)在肝细胞癌中的表达情况, 并进一步探索其与肝细胞癌临床病理特征的关系, 评价PFKFB3对肝细胞癌术后患者预后评价的意义, 预测PFKFB3推动肝细胞癌发展的机制.

方法: 检索、下载美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)的肿瘤公共数据集, 对表达谱资料及临床信息进行分析; 利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)方法, 分析受PFKFB3调控的相关基因.

结果: PFKFB3在高T分期肿瘤中高表达(P<0.05); 在不同年龄、谷丙转氨酶(alanine transaminase, ALT)、肿瘤大小、肿瘤结节数目、T分期、肝细胞癌巴塞罗那分期(Barcelona Clinic Liver Cancer stage, BCLC stage)、意大利肝细胞癌项目分期(Cancer Liver Italian Program stage, CLIP stage)的肝细胞癌患者中, PFKFB3的表达均有显著性差异(P<0.05); PFKFB3的表达状态与肝细胞癌患者术后的总体生存和复发相关(P<0.05); PFKFB3高表达样本富集了与细胞增殖、抗凋亡、代谢相关的基因集.

结论: PFKFB3与肝细胞癌多个病理指标相关, 且可以做为潜在的判断肝细胞癌患者预后的标志物和治疗肿瘤的靶标.

Keywords: 肝细胞癌; 6-磷酸果糖激酶2; 病理; 预后

核心提示: 目前研究6-磷酸果糖激酶2(6-phosphof

ructo-2-kinase, PFKFB3)表达与肿瘤患者预后关系的文章非常少, 本文首次利用了生物信息学手段证实PFKFB3与肝细胞癌患者术后预后的关系并初步分析了其可能机制. 不仅对于理解瓦博格效应的意义和机制有一定意义, 还进一步为PFKFB3抑制剂的研发和临床应用提供了依据和参考.