临床经验
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世界华人消化杂志. 2014-08-28; 22(24): 3649-3653
Published online 2014-08-28. doi: 10.11569/wcjd.v22.i24.3649
应用基因芯片筛选七氟醚和丙泊酚的诱导下胃黏膜表达差异基因
李月鹏, 高彩燕
李月鹏, 中国石油天然气集团公司中心医院麻醉科 河北省廊坊市 065000
高彩燕, 哈尔滨医科大学附属第一医院麻醉科 黑龙江省哈尔滨市 150001
李月鹏, 主治医师, 主要从事临床麻醉的研究.
作者贡献分布: 李月鹏负责论文研究的设计、资料收集与撰写; 高彩燕负责资料收集.
通讯作者: 李月鹏, 主治医师, 065000, 河北省廊坊市新开路51号, 中国石油天然气集团公司中心医院麻醉科. bingqiang193@126.com
电话: 0316-2075450
收稿日期: 2014-06-01
修回日期: 2014-06-19
接受日期: 2014-07-15
在线出版日期: 2014-08-28
Abstract

目的: 本文对行无痛胃镜检查的患者胃黏膜组织芯片表达谱进行分析, 分别利用吸入性麻醉剂七氟醚和静脉麻醉剂丙泊酚麻醉, 比较分析两种不同种类的麻醉剂诱导下表达发生显著改变的基因, 从功能方向筛选麻醉剂保护胃黏膜细胞的分子靶标以及保护机制.

方法: 从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库中下载编号为GSE4386的基因芯片, 数据为无痛胃镜检查的患者胃黏膜组织芯片表达谱数据, 共40个样本, 平均分成了两个组: 吸入性七氟醚麻醉和静脉麻醉剂丙泊酚, 每组20个样本, 分别为手术麻醉剂处理之前和经过麻醉剂手术后的胃黏膜组织表达谱. 采用R软件包对表达谱做数据预处理和差异表达基因的筛选. 筛选到的差异基因将进一步生物信息分析. 首先比较两个组中筛选得到的麻醉剂处理前后的差异表达基因, 得到两种麻醉剂刺激下诱导表达变化的基因, 并做各组间的表达值比较; 然后通过BLASTX对差异表达基因产物蛋白进行比对后进行COG功能分类注释; 再用WebGestalt寻找差异表达基因所在的相互作用功能模块; 最后利用DAVID搜索模块中差异基因参与的生物学过程.

结果: 共同表达的差异基因在七氟醚组和异丙酚组中分别占差异基因数目的百分比为31.3%(275/879)和94.8%(275/290). 且从功能注释分类及同在一个模块中差异基因的功能结果, 两种麻醉剂诱导影响的表达变异基因倾向于一致. 共同表达差异基因, 异丙酚诱导的差异基因和七氟醚诱导的差异基因主要参与的细胞转录和分化的过程.

结论: 吸入性麻醉剂七氟醚和静脉麻醉剂丙泊酚在保护胃黏膜作用中具有协同的作用, 因此, 我们推测, 吸入性麻醉剂七氟醚和静脉麻醉剂丙泊酚两种方式的静吸复合麻醉方式, 在无痛胃镜检查术中可能会具有更好保护胃黏膜细胞作用.

Keywords: 七氟醚; 丙泊酚; 无痛胃镜检查术; 功能注释; 功能模块

核心提示: 吸入性麻醉剂七氟醚和静脉麻醉剂丙泊酚两种方式的静吸复合麻醉方式, 在无痛胃镜检查术中可能会具有更好保护胃黏膜细胞作用.