Published online 2013-12-28. doi: 10.11569/wcjd.v21.i36.4146
修回日期: 2013-10-23
接受日期: 2013-11-06
在线出版日期: 2013-12-28
目的: 筛选胃癌血清差异表达蛋白, 寻找胃癌血清标志物.
方法: 采集胃癌患者血清和正常对照人群血清各45例, 所有血清样本去除高丰度血清蛋白质后, 采用相对和绝对定量同位素标志(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术联合二维液相色谱-串联质谱(two-dimensional liquid chromatography/tandem mass spectrometry, 2D-LC-MS/MS)分析和鉴定两组间的差异表达蛋白; 采用生物信息学对差异蛋白进行分析; 用Western blot对蛋白组中的代表性血清差异表达蛋白进行表达验证.
结果: iTRAQ标记联合2D-LC-MS/MS分析一共鉴定出10540条独特肽段, 对应199个非冗余蛋白, 其中符合条件的差异蛋白17个, 其中12个蛋白在胃癌患者中表达上调, 5个蛋白在胃癌患者中表达下调. 17种差异表达蛋白参与10种生物学过程、9种分子作用和2种细胞组分, 涉及的5个生物代谢途径. Western blot结果显示, 与正常对照人群相比, 代表性差异表达蛋白ITIH4在胃癌患者血清中表达量上调, 差异具有统计学意义(1.7517±0.247 vs 1±0, P<0.05).
结论: ITIH4可能是诊断胃癌新的潜在生物标志物.
核心提示: 胃癌(gastric cancer, GC)是严重危害人类健康的常见病和多发病, 可见早期诊断的意义尤为重要. 本研究通过iTRAQ结合2D-LC-MS/MS筛选GC血清差异表达蛋白并通过Western blot验证, 初步筛选得到ITIH4为GC差异表达蛋白, ITIH4可能是诊断GC的潜在生物标志物. 表明该技术用于GC生物标志物的血清蛋白质组学研究具有良好的前景.