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蛋白组学分析胰腺癌干细胞相关差异蛋白的表达
江建新, 潘耀振, 孙诚谊, 贵阳医学院附属医院肝胆外科 贵州省贵阳市 550001
高珊, 贵阳医学院附属医院消化内科 贵州省贵阳市 550001
江建新, 副主任医师, 主要从事肝胆胰脾疾病的基础与临床研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 81160311; 贵州省科技厅贵阳医学院社发联合基金资助项目, No. 黔科合[2010]3171; 贵阳市科技局基金资助项目, No. 筑科合[2011103] 22号; 贵州省肝胰疾病研究科技创新人才团队基金资助项目, No. 黔科合人才团队[2010]4010.
作者贡献分布: 主要实验、资料分析、统计及文章撰写由江建新完成; 研究设计、文章修改和审阅由孙诚谊完成; 资料分析、样本处理、生物信息学分析由高珊与潘耀振完成.
通讯作者: 孙诚谊, 教授, 550001, 贵州省贵阳市贵医街28号, 贵阳医学院附属医院肝胆外科. chengyisun@medmail.com.cn
电话: 0851-6773083
收稿日期: 2012-12-04
修回日期: 2012-12-26
接受日期: 2013-01-05
在线出版日期: 2013-01-18
修回日期: 2012-12-26
接受日期: 2013-01-05
在线出版日期: 2013-01-18
Abstract
目的: 筛选与鉴定胰腺癌干细胞相关的差异表达蛋白质.
方法: 以MIA-PaCa2(TIChigh)与BxPc-3(TIClow)为研究胰腺癌干细胞的工具细胞, 采用荧光差异双向凝胶电泳技术分离并筛选上述细胞差异表达蛋白, 反射式基质辅助激光解吸附电离串联飞行时间质谱鉴定差异蛋白, 免疫印迹验证差异表达的TRIM28.
结果: 获得了MIA-PaCa2(TIChigh)与BxPc-3(TIClow)荧光差异蛋白表达图谱, 经DeCyder v6.5软件分析, 共有23个差异在1.5倍以上的蛋白质点, 经质谱鉴定得到19个蛋白质, 相对于BxPc-3(TIClow), 在MIA-PaCa2(TIChigh)细胞组中高表达者有8个, 低表达者有11个, 包括参与细胞通讯和信号传导蛋白、免疫反应蛋白、转录因子与细胞周期调控蛋白、调节脂肪细胞分化和脂滴形成蛋白、细胞骨架蛋白、细胞黏附分子、差向异构酶、转运活性蛋白及参与翻译调节相关蛋白. 免疫印迹结果显示TRIM28在BxPc-3(TIClow)没有表达, 在MIA-PaCa2(TIChigh)高表达.
结论: 筛选得到的TRIM28等胰腺癌干细胞相关差异表达蛋白可能与胰腺癌干细胞的发生、发展和调控机制相关, 有望成为胰腺癌新的治疗靶点.
Keywords: 胰腺癌; 干细胞; 电泳; 凝胶; 双向; 蛋白质组学