Copyright
©The Author(s) 2013. Published by Baishideng Publishing Group Inc. All rights reserved.
世界华人消化杂志. 2013-04-18; 21(11): 1040-1045
Published online 2013-04-18. doi: 10.11569/wcjd.v21.i11.1040
Published online 2013-04-18. doi: 10.11569/wcjd.v21.i11.1040
遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNAs的筛选
田晰晰, 王跃, 张楠, 董坚, 昆明医科大学附属第一医院肿瘤内科 云南省昆明市 650032
珠珠, 黄鉴, 任俊宇, 陈明清, 昆明医科大学附属第一医院肿瘤科 云南省昆明市 650032
田晰晰, 在读硕士, 主要从事大肠肿瘤的相关研究.
基金项目: 云南省社会发展科技计划基金资助项目, No. 2011FB160.
作者贡献分布: 田晰晰与董坚对此文所做贡献均等; 此课题设计由董坚、陈明清、田晰晰及珠珠设计; 样本采集由田晰晰、珠珠、黄鉴、任俊宇、王跃、张楠及董坚操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由陈明清与董坚提供; 数据分析由田晰晰完成; 本论文写作由田晰晰、董坚及珠珠完成.
通讯作者: 董坚, 教授, 主任医师, 650032, 云南省昆明市西昌路295号, 昆明医科大学附属第一医院肿瘤内科. dongjian18@yahoo.com
电话: 0871-65361621 传真: 0871-65361621
收稿日期: 2013-01-28
修回日期: 2013-03-14
接受日期: 2013-03-29
在线出版日期: 2013-04-18
修回日期: 2013-03-14
接受日期: 2013-03-29
在线出版日期: 2013-04-18
Abstract
目的: 应用microRNA(miRNA)芯片筛选及qRT-PCR技术检测可作为遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNAs.
方法: 选取4个遗传性非息肉性大肠癌患者及3个无家族史正常人的血清miRNAs进行miRNA芯片检测, 再用q-PCR方法对于芯片结果进行验证.
结果: miRNA芯片筛查出57个上调及30个下调miRNAs, 在这些差异性表达的miRNAs中选出8个较为理想的miRNAs作进一步研究, 运用3个靶基因预测软件预测靶基因后取交集, 得到294个靶基因, 均是属于mir-20a-5p, mir-548b-5p和mir-548as-3p的靶基因. 用qPCR的方法在标本中进行验证发现mir-548as-3p的表达情况符合芯片结果-在遗传性非息肉性大肠癌患者血清中表达上调.
结论: 血清miRNAs在遗传性非息肉性大肠癌患者中的差异性表达, mir-548as-3p可能为遗传性非息肉性大肠癌非侵入性的生物标志物.
Keywords: 血清microRNAs; MicroRNAs芯片; 遗传性非息肉性大肠癌; 生物标志物
核心提示: 应用微小RNA(microRNA, miRNA)芯片筛选出可作为遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNA-mir-548as-3p, 在遗传性非息肉性大肠癌患者血清中显著表达上调. 通过qRT-PCR技术在样本中验证miRNA芯片结果的准确性.