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SELDI-TOF-MS联合LCM技术筛选大肠癌肝转移早期诊断标志蛋白
赵渊博, 王云海, 阿不都外力•吾守尔, 新疆医科大学第一附属医院胃肠外科 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市 830054
赵渊博, 硕士, 主要从事大肠癌蛋白质组学的研究.
作者贡献分布: 本研究的主要实验、数据分析和文章起草由赵渊博完成; 病例选择、样本取材及临床资料整理由王云海完成; 课题设计、文章修改和审阅由阿不都外力•吾守尔完成.
通讯作者: 阿不都外力•吾守尔, 副主任医师, 830054, 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市鲤鱼山南路137号, 新疆医科大学第一附属医院胃肠外科. 93978258@qq.com
电话: 0991-4366260 传真: 0991-4366262
收稿日期: 2011-11-21
修回日期: 2012-01-04
接受日期: 2012-02-06
在线出版日期: 2012-02-08
修回日期: 2012-01-04
接受日期: 2012-02-06
在线出版日期: 2012-02-08
Abstract
目的: 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱蛋白质芯片(SELDI-TOF-MS)联合激光显微切割(LCM)技术筛选大肠癌及其肝转移标志蛋白.
方法: 采用LCM技术获取24例大肠癌肝转移患者正常大肠、原发灶及肝转移灶癌细胞; 应用SELDI-TOF-MS技术对其行蛋白质谱分析; 采用Biomarker Wizard软件分析差异蛋白; 通过查询蛋白库对特定分子质量所对应的标志蛋白进行初步确定.
结果: 比较3组细胞间的SELDI质谱图, 发现大肠癌原发灶与正常大肠两组间存在15个标志蛋白, 12个表达上调, 3个表达下调; 大肠癌肝转移灶与原发灶两组间存在9个标志蛋白, 5个表达上调, 4个表达下调. 其中质荷比4 676.63 Da, 11 740.87 Da, 21 063.59 Da和22 783.36 Da, 蛋白峰差异性最明显(P<0.01). 通过查询ExPasy蛋白库筛选出20个差异蛋白, 包括整合膜蛋白2C、DNA修复蛋白RAD51同系物4、细胞周期检查点蛋白RAD1、人附睾蛋白4、着丝粒蛋白R、Pleckstrin同源结构域家族成员3等. 其中细胞凋亡调节Bax蛋白γ亚型、蛋白质S100A11(Protein S100-A11)、Raf激酶抑制蛋白(RKIP)和热休克蛋白27(HSP-27)在正常大肠、原发灶及肝转移灶癌细胞中均呈差异性表达, 并且差异性最明显(P<0.01).
结论: SELDI蛋白质芯片联合LCM技术有可能筛选出敏感性高、特异性强的大肠癌标志蛋白, 筛选出的差异蛋白可能是大肠癌及其肝转移特异性生物标志物.
Keywords: SELDI-TOF-MS; 激光捕获显微切割; 大肠癌; 肝转移; 蛋白质组学