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世界华人消化杂志. 2012-06-08; 20(16): 1407-1414
Published online 2012-06-08. doi: 10.11569/wcjd.v20.i16.1407
Published online 2012-06-08. doi: 10.11569/wcjd.v20.i16.1407
MicroRNA在直肠癌中的表达谱
屈昌民, 梁淑文, 李连勇, 曹艳菊, 王晓英, 翟静妤, 宫淑娟, 中国人民解放军第306医院消化内科 北京市 100101
刘庆森, 中国人民解放军总医院消化内科 北京市 100853
作者贡献分布: 屈昌民与李连勇对此文所作贡献均等; 此课题由屈昌民、李连勇及刘庆森共同设计; 研究过程由屈昌民、梁淑文及李连勇负责实施; 数据分析由屈昌民与李连勇完成; 标本采集由曹艳菊、王晓英、翟静妤及宫淑娟完成; 本论文写作由屈昌民、梁淑文及李连勇完成.
通讯作者: 李连勇, 博士, 100101, 北京市朝阳区, 中国人民解放军第306医院消化内科. lilianyong001@163.com
电话: 010-66356729
收稿日期: 2011-08-24
修回日期: 2012-05-03
接受日期: 2012-05-13
在线出版日期: 2012-06-08
修回日期: 2012-05-03
接受日期: 2012-05-13
在线出版日期: 2012-06-08
Abstract
目的: 研究直肠癌microRNA(miRNA)表达谱, 以期发现直肠癌发生过程和正常直肠黏膜组织的miRNA差异表达谱, 并理论上预测可能受其调控的靶基因.
方法: 选择2011-01/03于中国人民解放军第306医院肠镜检查的进展期直肠癌患者, 对直肠癌及正常组织进行miRNA芯片检测, 筛选直肠癌、正常直肠组织差异表达的miRNA, 并运用Gomir分析软件筛选TargetScan、PicTar、miRanda 3个预测软件同时预测出的靶基因.
结果: 选择直肠癌组织、正常直肠黏膜组织标本各2例, 通过Affymetrix miRNAs芯片检测, 发现直肠腺癌与正常直肠黏膜相比, 上调的miRNA为miR-15a、miR-18a、miR-18a*、miR-21、miR-24-2*、miR-27a等37种, 下调的为miR-139-5p、miR-139-3p、miR-215、miR-200b、miR-133a、miR-150等18种. 依据Ratio值, 选择其中最高者miR-31和最低者miR-375进行预测其靶基因. 预测ZFHX4可能为miR-375的靶基因, 预测BACH2、FZD3等可能为miR-31的靶基因.
结论: 直肠癌和正常直肠黏膜相比有其特异的miRNA表达谱, miRNA在直肠癌的发生中可能起到重要作用, 受其调控的靶基因及作用方式值得进一步研究.
Keywords: 直肠癌; 微小RNA; 芯片; 表达谱