临床研究
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世界华人消化杂志. 2011-02-28; 19(6): 588-595
Published online 2011-02-28. doi: 10.11569/wcjd.v19.i6.588
肝癌相关基因表达的荧光定量PCR检测及分子诊断指数的建立
余俊, 王毅军, 高英堂, 石文霞, 王瞿辉, 刘彤, 许彦杰, 杨斌, 杜智
余俊, 天津医科大学第三中心临床学院 天津市 300170
王毅军, 天津市第三中心医院肝胆外科 天津市 300170
高英堂, 王瞿辉, 许彦杰, 杨斌, 杜智, 天津市第三中心医院 天津市人工细胞重点实验室 天津市 300170
石文霞, 刘彤, 天津市第三中心医院 天津市肝胆疾病研究所 天津市 300170
余俊, 在读硕士, 主要从事肝、胆、胰腺疾病方面的研究.
基金项目: 天津市重点科技攻关基金资助项目, No. 05YFSZSF02500;天津市卫生局基金面上资助项目, No. 09KY04.
作者贡献分布: 此课题由王毅军与杜智设计; 荧光定量PCR检测及论文撰写由余俊完成; 数据分析由高英堂与石文霞完成; 生物信息学分析由杨斌完成; 实验标本收集与管理由王毅军、王瞿辉、刘彤及许彦杰完成.
通讯作者: 王毅军, 教授, 300170, 天津市河东区津塘路83号, 天津市第三中心医院肝胆外科. wangyijuncarl@yahoo.com.cn
电话: 022-84112205 传真: 022-84112205
收稿日期: 2010-11-25
修回日期: 2011-01-09
接受日期: 2011-01-11
在线出版日期: 2011-02-28
Abstract

目的: 研究肝细胞癌相关基因表达, 建立肝癌分子诊断指数, 以期能更准确的诊断肝癌.

方法: 采用实时荧光定量PCR检测40例肝细胞癌患者癌组织和配对的癌旁2 cm及手术切缘组织、10例肝硬化组织、10例正常肝脏组织中11个基因的表达, 以管家基因G3PDH为对照, 2-ΔΔCT法计算目的基因相对表达量, 挑选出特异性好且与正常肝、肝硬化组织表达差异大的肝癌相关基因, 依据这些基因在组织中表达异常的个数建立分子诊断指数.

结果: 在40例癌组织中, 抑癌基因PRDM2、IGFBP3、DLC-1分别有65.0%、75.0%、67.5%的标本表达<3倍正常肝组织, 癌基因GPC3、STMN、CCNA2、BIRC5、AFP分别有87.5%、77.5%、82.5%、85.0%、67.5%的标本表达>3倍正常肝组织, 并且与肝硬化组织表达差异显著(0.45±0.69 vs 0.50±0.20; 0.17±0.20 vs 0.67±0.47; 0.29±0.48 vs 0.58±0.60; 677.57±999.30 vs 4.41±3.99; 17.56±28.28 vs 1.17±1.08; 53.17±103.64 vs 2.09±1.50; 16.53±16.39 vs 1.82±1.39; 4 445.70±1 1642.87 vs 0.86±0.43, 均P<0.05). 以此8个基因建立分子诊断指数, 其在肝硬化、手术切缘、癌旁2 cm、癌组织中分别为2.2±1.5、3.0±1.6、2.9±1.5、6.3±1.2, 癌组与肝硬化组、切缘组、癌旁2 cm组差异显著. 以肝硬化组作为对照组, 当分子诊断指数≥4诊断为肝癌时, ROC曲线的敏感性为100%, 特异性为90%, AUC = 0.995.

结论: 利用荧光定量PCR检测肝癌相关基因表达, 成功建立分子诊断指数, 提高了肝癌诊断的敏感性及特异性.

Keywords: 肝细胞癌; 基因; 表达; 实时荧光定量PCR; 分子诊断指数