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世界华人消化杂志. 2011-11-18; 19(32): 3365-3369
Published online 2011-11-18. doi: 10.11569/wcjd.v19.i32.3365
Published online 2011-11-18. doi: 10.11569/wcjd.v19.i32.3365
幽门螺杆菌实验室长期传代cagA启动子的进化
宋衍燕, 王海滨, 北京市朝阳区疾病预防控制中心 北京市 100021
宋衍燕, 王海滨, 何利华, 张建中, 中国疾病预防控制中心传染病所 北京市 102206
作者贡献分布: 本研究由宋衍燕与张建中设计; 引物设计以及PCR扩增由宋衍燕完成; 序列分析由王海滨与宋衍燕完成; 细菌培养由何利华与宋衍燕完成; 论文写作由宋衍燕与张建中完成.
通讯作者: 张建中, 102206, 北京市, 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所. helico99@sina.com
电话: 010-58900754
收稿日期: 2011-09-09
修回日期: 2011-10-28
接受日期: 2011-11-04
在线出版日期: 2011-11-18
修回日期: 2011-10-28
接受日期: 2011-11-04
在线出版日期: 2011-11-18
Abstract
目的: 评价实验室长期多次传代对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, H. pylori)标准菌株26695 cagA启动子基因稳定性的影响.
方法: PCR方法扩增54个不同批次保存的经过多次传代的H. pylori 26695克隆子的cagA启动子, 并进行测序, 使用Vector NTI Suite 6软件比对序列.
结果: 54个H. pylori 26695克隆子的cagA启动子序列有22个(40.74%)与NCBI公布的序列完全一致, 32个(59.26%)在不同位点发生碱基置换、缺失、插入等突变, 其中第17位碱基有5个(15.63%)发生T→C突变, 第199位碱基有14个(43.75%)发生A→C的变异, 在159-160重复碱基A处有12个(37.5%)发生缺失1个或者2个A, 还有一个多出2个A.
结论: 长期多次传代会导致H. pylori cagA启动子突变, 实验室使用标准菌株要注意传代记录, 建立不同等级实验室质控, 根据使用标准菌株研究内容的水平决定实验室质控的等级.
Keywords: 幽门螺杆菌; cagA启动子; 基因突变; 进化