临床研究
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世界华人消化杂志. 2011-08-08; 19(22): 2328-2333
Published online 2011-08-08. doi: 10.11569/wcjd.v19.i22.2328
食管鳞癌组织及周围正常食管黏膜组织差异表达基因的筛选
赵路, 杨娟, 于婧, 张红, 高冬玲, 陈奎生
赵路, 杨娟, 于婧, 张红, 高冬玲, 陈奎生, 郑州大学第一附属医院病理科 河南省郑州市 450052
赵路, 在读硕士, 主要从事肿瘤病理的研究.
基金项目: 郑州市科技创新团队基金资助项目, No. 096SYJH33097.
作者贡献分布: 赵路与杨娟对此文所作贡献均等; 此课题由陈奎生与赵路设计; 研究过程由赵路、杨娟、于婧、张红、高冬玲及陈奎生操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由陈奎生提供; 数据分析由赵路与杨娟完成; 本论文写作由赵路与杨娟完成.
通讯作者: 陈奎生, 教授, 450052, 河南省郑州市, 郑州大学第一附属医院病理科. chenksh2002@yahoo.com.cn
电话: 0371-66658175
收稿日期: 2011-04-29
修回日期: 2011-07-18
接受日期: 2011-07-22
在线出版日期: 2011-08-08
Abstract

目的: 研究食管鳞癌组织及周围正常食管黏膜组织的差异表达基因, 为寻找食管鳞癌早期诊断高敏感性, 高特异性的分子指标提供理论依据.

方法: 分别抽提人食管鳞癌组织及周围正常食管黏膜组织总mRNA, 逆转录成cDNA, 用单标法以Cy3-dUTP为标记制成探针, 与基因芯片进行杂交, 筛选出差异表达的基因, 并用生物信息学方法做进一步分析.

结果: 在45 051个人类全基因组芯片中依Ratio实验组(癌组织)/对照组(正常食管组织)>4.0或<0.25的数据项, 共发现1 113条差异表达基因, 其中464条上调, 649条下调. 经生物信息学分析, 表明包含多种功能基因. RT-PCR验证其中3条基因, 表达方向与芯片检测结果一致, 符合预期结果.

结论: 在食管鳞癌的发生、发展中存在着大量异常表达基因; 基因芯片是一高效筛选食管癌相关基因的方法.

Keywords: 基因芯片; 食管鳞癌; 差异表达基因