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MicroRNA在人结肠癌干细胞中的表达谱
邹健, 于晓峰, 虞阳, 张颖, 史冬梅, 刘雪静, 复旦大学附属华东医院消化科 上海市 200040
董洁, 复旦大学附属华东医院呼吸科 上海市 200040
李天奇, 复旦大学附属华东医院心内科 上海市 200040
基金项目: 复旦大学青年科学基金资助项目, No. 08FQ49.
作者贡献分布: 此课题由邹健设计; 研究过程由邹健、于晓峰、虞阳、张颖、史冬梅、董洁、李天奇及刘雪静操作完成; 数据分析由邹健与董洁完成; 论文写作由邹健完成.
通讯作者: 邹健, 200040, 上海市延安西路221号, 复旦大学附属华东医院消化科. apollozou@hotmail.com
电话: 021-62483180
收稿日期: 2009-10-31
修回日期: 2009-11-21
接受日期: 2009-11-30
在线出版日期: 2010-01-18
修回日期: 2009-11-21
接受日期: 2009-11-30
在线出版日期: 2010-01-18
Abstract
目的: 探讨微小RNA(microRNA, miRNA)在人结肠癌干细胞中的表达, 为进一步研究miRNA调控结肠癌干细胞向结肠癌细胞分化的分子机制奠定基础.
方法: 应用miRNA表达谱芯片检测人结肠癌干细胞和已分化结肠癌细胞中miRNA的表达谱. 利用实时定量PCR技术检测两种细胞中差异表达的miRNA, 验证miRNA芯片结果的可靠性. 应用软件对筛选出的显著差异表达miRNA的靶基因进行预测.
结果: 与已分化结肠癌细胞相比, 人结肠癌干细胞中表达上调超过1.5倍的miRNA有35个, 为: hsa-miR-192, hsa-miR-29b, hsa-miR-215, hsa-miR-194, hsa-miR-33a, hsa-miR-32等; 表达下调超过1.5倍的miRNA有11个, 为: hsa-miR-93, hsa-miR-1231, hsa-miR-524-3p, hsa-miR-886-3p等. PCR技术验证, 与miRNA芯片结果相符合. 表达显著上调miRNA的共同靶mRNA有: AFF2、MTF1、RUNDC2C和ZFHX4. 表达显著下调miRNA的共同靶mRNA有: ONECUT2、SH3TC2、PTPRT、RNABP10、NR3C1、RGSL1、RNASEL和 TANC2.
结论: 筛选出的差异表达miRNA可能参与结肠癌的发病, 为该病诊治提供了新的思路. 其共同靶基因可能具有重要的调控结肠癌干细胞生长和分化的作用.
Keywords: 微小RNA; 结肠癌; 干细胞; 表达谱