基础研究
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世界华人消化杂志. 2009-10-18; 17(29): 2978-2983
Published online 2009-10-18. doi: 10.11569/wcjd.v17.i29.2978
乙型肝炎病毒中国流行株B、C、D/C及A基因型的全基因克隆与序列分析
黄维金, 周诚, 王佑春, 张华远, 吴星, 梁争论, 李河民
黄维金, 周诚, 王佑春, 张华远, 吴星, 梁争论, 李河民, 中国药品生物制品检定所 北京市 100050
黄维金, 在读博士, 助理研究员, 主要从事HBV、HEV及HIV的研究.
基金项目: 国家科技支撑计划基金资助项目, No. 2008BA154B08.
作者贡献分布: 黄维金与周诚贡献均等; 此课题由王佑春、张华远及李河民设计; 研究过程由黄维金、周诚及吴星操作完成; 研究所用新试剂与分析工具由梁争论与周诚提供; 数据分析由黄维金完成; 论文写作由黄维金与周诚完成.
通讯作者: 周诚, 研究员, 100050, 北京市天坛西里2号, 中国药品生物制品检定所. zhouch@nicpbp.org.cn
电话: 010-67095448
收稿日期: 2009-09-08
修回日期: 2009-09-28
接受日期: 2009-09-28
在线出版日期: 2009-10-18
Abstract

目的: 扩增克隆乙型肝炎病毒(HBV)B, C, D/C及A基因型的全基因组, 构建不同基因型的全基因序列克隆.

方法: 从中国慢性乙型肝炎患者血清提取DNA以L-PCR技术对3.2 kb的HBV DNA进行扩增, 纯化后克隆到TA载体. 对于HBV不同基因型的全基因序列利用Simplot、DNAStar(Clustal W方法的MegAlign和Phylogenetic tree)等生物软件进行分析.

结果: 克隆出我国主要存在的几种HBV DNA全基因序列: B、C、D/C和A基因型, 包括: adr、adw、ayw血清型. B基因型(adw血清型)全基因序列长度为3215 bp, C基因型(adrq+血清型)为3215 bp, D/C基因型(ayw2血清型)为3215 bp, A基因型(adw血清型)为3182 bp, 均递交GenBank. 在H3样品中的4个全基因克隆中存在一个同时含有2853-2885 nt缺失突变和核心区的1762A-T、1764G-A双位点突变的变异株, 表明同一个体中同时存在突变株和野生株, 可能是耐抗病毒药物的分子基础.

结论: 本研究克隆了我国有报道存在的主要基因型、血清型的HBV全基因序列, 为全面了解我国HBV基因型和血清型提供了序列资料.

Keywords: 乙型肝炎病毒; 基因型; 血清型; 基因组