临床经验
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世界华人消化杂志. 2009-09-28; 17(27): 2854-2858
Published online 2009-09-28. doi: 10.11569/wcjd.v17.i27.2854
SELDI-TOF-MS联合蛋白质组学实验数据库对结直肠癌血清标志物的鉴定
蔡建, 高春芳, 范乃军, 盛新华, 赵光, 王秀丽
蔡建, 范乃军, 盛新华, 中国人民解放军第二军医大学 上海市 200433
蔡建, 高春芳, 赵光, 王秀丽, 中国人民解放军第150中心医院全军肛肠外科研究所 河南省洛阳市 471031
作者贡献分布: 蔡建与高春芳对此文所作贡献均等; 此课题由蔡建与高春芳设计; 研究过程由蔡建、高春芳、范乃军、盛新华、赵光及王秀丽操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由高春芳提供; 数据分析由蔡建、赵光及王秀丽完成; 本论文写作由蔡建与范乃军完成.
通讯作者: 高春芳, 教授, 博士生导师, 471031, 河南省洛阳市, 中国人民解放军第150中心医院全军肛肠外科研究所. gaochunfang150@163.com
电话: 0379-64169323
收稿日期: 2009-04-23
修回日期: 2009-08-27
接受日期: 2009-09-07
在线出版日期: 2009-09-28
Abstract

目的: 探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)联合蛋白质组学实验数据库方法研究结直肠癌患者血清标志物的可行性.

方法: 应用SELDI-TOF-MS对169例结直肠癌患者与83例正常人血清进行了蛋白质谱检测, 通过Biomarker WizardTM与Biomarker PatternsTM软件分析发现差异蛋白, 建立结直肠癌诊断模型; 用蛋白质组学实验数据库检索鉴定出有意义的差异蛋白, 并用ELISA法对结直肠癌患者及正常人血清样本中差异蛋白表达进行验证.

结果: 发现34种差异蛋白, 以质荷比(m/z)为2873, 3163, 6121, 7778的4种差异蛋白组成的分类树诊断模型, 在学习模式下其诊断结直肠癌的灵敏度为91.57%, 特异度为90.53%; 在测试模式下分别为82.25%, 80.72%. 其中m/z为7778的蛋白峰强度在结直肠癌患者血清中明显高于正常人(P<0.01), 数据库检索结果提示该蛋白为血小板因子4(PF4). ELISA法测定结直肠癌患者血清PF4水平显著高于正常人(P<0.01), 其灵敏度及特异度分别为61.1% , 76.9%.

结论: SELDI-TOF-MS联合蛋白质组学实验数据库的方法简便可行, 可为蛋白芯片研究提供新思路; PF4(m/z = 7 778)在结直肠癌患者血清中明显升高, 是结直肠癌患者新的血清学标志物.

Keywords: 结直肠癌; 血小板因子4; 生物标志物; 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱; 蛋白质组学实验数据库