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肝癌差异表达基因EEG1的克隆和鉴定
黄春玲, 张忠英, 厦门大学附属中山医院临床检验中心 福建省厦门市 361004
王效民, 邱兴峰, 刘平果, 李岗山, 彭友源, 厦门大学附属中山医院肝胆外科 福建省厦门市 361004
黄春玲, 1999年福建医科大学本科毕业, 2002年福建医科大学临床检验诊断学硕士, 主管技师, 主要从事分子诊断学的研究工作.
作者贡献分布: 此课题由黄春玲, 王效民, 张忠英设计; 研究过程由黄春玲, 王效民, 张忠英, 邱兴峰, 刘平果, 李岗山及彭友源操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由王效民提供; 数据分析由黄春玲, 张忠英完成; 本论文写作由黄春玲, 王效民, 张忠英完成.
通讯作者: 王效民, 361004, 福建省厦门市湖滨南路201-209号, 厦门大学附属中山医院肝胆外科. wxm@xmzsh.com
电话: 0592-2292203 传真: 0592-2212328
收稿日期: 2006-05-20
修回日期: 2008-01-20
接受日期: 2008-01-15
在线出版日期: 2008-03-18
修回日期: 2008-01-20
接受日期: 2008-01-15
在线出版日期: 2008-03-18
Abstract
目的: 筛选和克隆肝癌和正常肝组织差异表达的基因片段, 以探讨肝癌的发病机制.
方法: 应用mRNA差异显示技术(mRNA-DD), 比较肝癌及正常肝组织基因表达的差异, 对获得的差异基因片段进行克隆、测序, 测序结果提交GenBank数据库中进行同源性分析, 并对其中一条有明显差异的基因用半定量RT-PCR分析该基因在正常肝组织及肝癌组织中的表达情况.
结果: 凝胶扫描显示在500-600 bp处有一条差异片段, 差异条带经酶切图谱分析证实重组质粒是目的克隆, 将片段测序结果与GenBank数据库进行同源性比较发现该片段与已知基因EEG1高度同源(99%). RT-PCR结果显示在肝癌组织中EEG1 mRNA的表达水平明显低于正常肝癌组织(P = 0.001).
结论: EEG1基因在肝癌组织中的表达明显低于正常肝组织, 提示EEG1基因的表达下调可能与肝癌的发病有关.
Keywords: 肝癌; mRNA差异显示; 基因克隆