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世界华人消化杂志. 2008-09-28; 16(27): 3091-3094
Published online 2008-09-28. doi: 10.11569/wcjd.v16.i27.3091
Published online 2008-09-28. doi: 10.11569/wcjd.v16.i27.3091
乙型肝炎病毒B基因型亚型的检测
龚玉华, 谭友文, 李春明, 金跃明, 吴翠松, 张圆海, 刁仁联, 镇江市第三人民医院 江苏省镇江市 212021
基金项目: 镇江市社会发展资助项目, No. SH2006046.
作者贡献分布: 此课题由龚玉华完成; 研究过程由龚玉华, 李春明, 谭友文, 金跃明, 吴翠松及张圆海完成; 实验操作由龚玉华与刁仁联完成; 数据分析由龚玉华完成; 本论文写作由龚玉华完成.
通讯作者: 龚玉华, 212021, 江苏省镇江市戴家门300号, 镇江市第三人民医院检验科. gyh5511@163.com.cn
电话: 0511-88970670, 88970779 传真: 0511-88970665
收稿日期: 2008-06-02
修回日期: 2008-08-17
接受日期: 2008-08-26
在线出版日期: 2008-09-28
修回日期: 2008-08-17
接受日期: 2008-08-26
在线出版日期: 2008-09-28
Abstract
目的: 建立乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)B基因型亚型的检测方法, 并对其进行临床研究.
方法: 根据GenBank中20株Ba亚型, 10株Bj亚型以及25株C型全长基因组序列设计Ba、Bj亚型特异探针以及巢式PCR引物. 采用反向杂交技术将B亚型特异探针固定在芯片上, 通过与地高辛标记的扩增产物杂交检测B型HBV亚型. 对镇江地区200例B基因型HBV血清样本进行亚型分析并对患者HBV DNA YMDD变异进行检测, 通过对部分血清中的HBV DNA进行序列分析验证该方法的准确性.
结果: 200例B基因型HBV患者中, Ba亚型184例(92%), Bj亚型16例(8%). 在持续使用拉米呋啶的80例患者中, Bj亚型6(0%)例, 均无YMDD变异, Ba亚型74例, YMDD变异21(28.4%)例.
结论: 镇江地区B基因型HBV以Ba亚型为主, Ba、Bj亚型在服用拉米呋啶1年后发生YMDD变异的几率并无统计学上的显著差异.
Keywords: 乙型肝炎病毒; 基因型; 基因亚型; 寡核苷酸芯片