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世界华人消化杂志. 2008-08-28; 16(24): 2695-2701
Published online 2008-08-28. doi: 10.11569/wcjd.v16.i24.2695
Published online 2008-08-28. doi: 10.11569/wcjd.v16.i24.2695
一种新的乙型肝炎病毒X基因变异方式
肖鸿敏, 任建林, 许鸿志, 陈美娅, 张志平, 周飞, 潘金水, 蔡稼燕, 董菁, 厦门大学附属中山医院消化内科 福建医科大学教学医院(厦门大学附属中山医院) 厦门大学消化疾病研究所 厦门市消化疾病中心 福建省厦门市 361004
毛乾国, 厦门中医院肝病三科 福建省厦门市 361004
肖鸿敏, 福建医科大学硕士在读, 主要从事HBx与宿主蛋白相互作用的研究.
基金项目: 厦门市首批重大疾病科研攻关资助项目, No. WKZ0501; 厦门市卫生局医学科研立项资助项目, No. WSK0506; 厦门大学引进人才科研启动基金资助项目, No. Z03109; 福建省青年科技人才创新资助项目, No. 2006F3127
作者贡献分布: 此课题由任建林与董菁设计; 研究过程由肖鸿敏, 许鸿志, 周飞, 陈美娅, 蔡稼燕及张志平操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由任建林与董菁提供; 数据分析由董菁, 潘金水及毛乾国完成; 本论文写作由肖鸿敏, 董菁及周飞完成.
通讯作者: 董菁, 361004, 福建省厦门市湖滨南路201号, 厦门大学附属中山医院消化内科. dj@xmzsh.com
电话: 0592-2293171 传真: 0592-2293171
收稿日期: 2008-06-12
修回日期: 2008-07-28
接受日期: 2008-08-04
在线出版日期: 2008-08-28
修回日期: 2008-07-28
接受日期: 2008-08-04
在线出版日期: 2008-08-28
Abstract
目的: 证实乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)X基因一种新的变异方式.
方法: 从HBV慢性感染患者血清中提取HBV DNA, 扩增X基因序列, 克隆入pMD19 T载体, 选择阳性克隆进行DNA测序, 与已知HBV基因相应序列比较该患者体内HBV基因变异位点以及变异形式.
结果: 从21例患者中共挑选74个克隆测序, 测序结果提示54个克隆X基因下游大段缺失突变, 长度达234 nt, 位于1601-1834 nt处, 另有1个克隆发生245 nt缺失突变. 发生缺失变异的病毒株同时存在G/A1515C、G1518C和A1585T替换突变, 这两种突变具有联动特征. 缺失突变株HBx仅编码76 aa, 其第44和45位编码为LL, 具有特异性.
结论: 观察到一种X蛋白变异方式, 这种大段缺失突变导致X蛋白下游编码序列丢失, 其为X因子还是X蛋白以及这种变异是否为常态形式尚需进一步研究.
Keywords: 乙型肝炎病毒; 缺失突变; X因子