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世界华人消化杂志. 2008-06-18; 16(17): 1849-1854
Published online 2008-06-18. doi: 10.11569/wcjd.v16.i17.1849
Published online 2008-06-18. doi: 10.11569/wcjd.v16.i17.1849
胰腺癌细胞基因组范围内的基因缺失
林连捷, 郑长青, 金玉, 胡刚正, 刘香, 林艳, 中国医科大学附属盛京医院消化内科 辽宁省沈阳市 110004
王玉峰, 沈阳二四五医院药剂科 辽宁省沈阳市 110042
林连捷, 2007年中国医科大学博士, 讲师, 主治医师, 主要从事消化系统疾病的分子生物学和遗传学研究.
作者贡献分布: 此课题由林连捷和郑长青设计; 研究过程由林连捷, 王玉峰, 金玉, 胡刚正, 刘香, 林艳操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由林连捷, 王玉峰, 郑长青提供; 数据分析由林连捷完成; 本论文写作由林连捷完成.
通讯作者: 林连捷, 110004, 辽宁省沈阳市三好街36号, 中国医科大学附属盛京医院消化内科. audreylin73@hotmail.com
电话: 024-83956383
收稿日期: 2008-02-03
修回日期: 2008-03-19
接受日期: 2008-05-06
在线出版日期: 2008-06-18
修回日期: 2008-03-19
接受日期: 2008-05-06
在线出版日期: 2008-06-18
Abstract
目的: 研究胰腺癌细胞基因组范围内的纯合性缺失和杂合性缺失(loss of heterozygosity, LOH).
方法: 应用高密度单核苷酸多态性芯片和专用分析软件, 检测17种胰腺癌细胞株基因组范围内的纯合性缺失和LOH, 并筛选可能与胰腺癌发生、发展有关的基因区域, 用PCR验证纯合性缺失.
结果: 经过PCR验证, 26个区域确实为纯合性缺失, 芯片的准确度为83.9%(26/31). 这些缺失区域中, 平均每个区域只涉及1.29个基因. 每一种细胞都有不同程度的LOH; 不同染色体臂出现LOH频率不同, 出现频率最高的为染色体臂9p和18q, 均为94.1%.
结论: 胰腺癌全基因组范围内出现多处LOH和纯合性缺失, 这些区域可能含有新抑癌基因.
Keywords: 单核苷酸多态性芯片; 杂合性缺失; 纯合性缺失; 胰腺癌