临床研究
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世界华人消化杂志. 2008-05-18; 16(14): 1525-1529
Published online 2008-05-18. doi: 10.11569/wcjd.v16.i14.1525
应用基因芯片对人肝纤维化相关基因的筛查
罗新华, 杨勤, 张权, 程明亮
罗新华, 张权, 程明亮, 贵阳医学院附属医院感染科 贵州省贵阳市 550004
杨勤, 贵阳医学院病理生理学教研室 贵州省贵阳市 550004
罗新华, 贵阳医学院在读博士, 副主任医师, 主要从事病毒性肝炎肝纤维化的研究.
基金项目: 贵州省优秀青年科技人才基金资助项目, No. 20050518; 贵州省省长基金资助项目, No. 2005223; 贵州省卫生厅科技基金资助项目, No. 2006046.
作者贡献分布: 此课题由罗新华, 程明亮及杨勤设计; 研究过程由罗新华和张权操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由程明亮提供; 数据分析由罗新华完成;本论文写作由罗新华和杨勤共同完成.
通讯作者: 程明亮, 550004, 贵州省贵阳市北京路4号, 贵阳医学院附属医院感染科. chengml@21cn.com
电话: 0851-6813394传真: 0851-6813394
收稿日期: 2007-11-14
修回日期: 2008-03-17
接受日期: 2008-05-10
在线出版日期: 2008-05-18
Abstract

目的: 筛查肝纤维化组织相关基因, 探讨肝纤维化发生机制.

方法: 抽提肝纤维化组织和正常肝组织总RNA来制备探针, 经杂交、洗涤后, 通过计算机扫描分析肝纤维化组织和正常肝组织基因表达谱的差异情况, 并用实时荧光定量PCR技术对其中部分差异基因的表达水平变化进行验证.

结果: 筛选出差异表达的基因68个, 其中肝纤维化组织中表达上调的基因35个, 表达下调的基因33个, 这些基因按照功能可以分为调控细胞信号转导、DNA损伤与修复、转录调控因子、代谢相关基因以及未知功能基因. 与正常肝组织比较, 肝纤维化组织中C/EBPβ mRNA表达下调(22.02±4.82 vs 59.13±8.21, P<0.01), MMP-14 mRNA表达上调(257.33±26.58 vs 21.65±4.37, P<0.01), 结果与基因芯片一致.

结论: 多种基因参与肝纤维化的形成过程, 肝纤维化组织与正常肝组织之间存在有明显的基因表达差异.

Keywords: 肝纤维化; 肝组织; 基因芯片; 基因表达; 实时荧光定量PCR技术