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世界华人消化杂志. 2008-05-18; 16(14): 1487-1492
Published online 2008-05-18. doi: 10.11569/wcjd.v16.i14.1487
Published online 2008-05-18. doi: 10.11569/wcjd.v16.i14.1487
亚硝胺诱导食管癌变早期基因差异表达与表观遗传修饰的关系
吴强强, 魏亚宁, 张素珍, 舒青, 中国人民解放军第四军医大学基础部医学遗传学与发育生物学教研室 陕西省西安市 710032
吴强强, 在读硕士研究生, 主要从事肿瘤分子遗传学方面的研究.
作者贡献分布: 此课题由吴强强和魏亚宁设计; 研究过程由吴强强和魏亚宁操作完成; 舒青监督本研究完成过程; 研究所用试剂及分析工具由张素珍负责; 数据分析由吴强强和魏亚宁完成; 本论文写作由吴强强, 魏亚宁及舒青完成.
通讯作者: 舒青, 710032, 陕西省西安市长乐西路17号, 中国人民解放军第四军医大学基础部医学遗传学与发育生物学教研室. qingshu@fmmu.edu.cn
电话: 029-84774490
收稿日期: 2008-02-19
修回日期: 2008-03-19
接受日期: 2008-05-10
在线出版日期: 2008-05-18
修回日期: 2008-03-19
接受日期: 2008-05-10
在线出版日期: 2008-05-18
Abstract
目的: 通过基因芯片技术检测亚硝胺诱导食管癌变过程中, 食管组织基因表达的差异, 分析不同阶段基因表达的特点以及基因差异表达与DNA甲基化的相关性.
方法: 小鼠随机分为2组, A组(对照组)40只, 灌喂蒸馏水; B组(实验组)70只, 灌喂诱导混合物(20 g/L亚硝酸钠+200 g/L N, N-二甲基苄胺). 在诱导时间4、8、20 wk时, 提取食管组织RNA, 反转录合成cDNA, 并与芯片杂交, 对芯片结果进行分析, 比较诱导进程中不同组别的表达差异.
结果: 亚硝胺诱导早期病变进程中原癌基因表达的变化呈现整体逐步上升的趋势, 且阶段表达特性显著, 但多数抑癌基因未表现出明显变化. 甲基化酶基因在4 wk无明显改变, 但在8、20 wk稍有升高, 去甲基化酶基因中Mbd2b从8 wk开始上调, 但Gadd45a从4 wk就已诱导上调, 8、20 wk依然明显上调. 未发现明显改变的组蛋白乙酰化酶基因.
结论: 在亚硝胺诱导食管癌变过程中, 大量基因的上调表达可能与早期基因组的低甲基化密切相关, Gadd45a可能参与了诱导早期的脱甲基作用.
Keywords: 基因芯片; 食管癌; 亚硝胺; 表观遗传修饰; DNA甲基化; DNA脱甲基化; 组蛋白乙酰化; 组蛋白脱乙酰化