临床经验
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世界华人消化杂志. 2007-03-08; 15(7): 746-749
Published online 2007-03-08. doi: 10.11569/wcjd.v15.i7.746
不同地区幽门螺杆菌cagA基因羧基端可变区及其蛋白序列差异分析
吴莺, 张尤历, 王文兵, 陈劲频, 沈琰
吴莺, 张尤历, 陈劲频, 沈琰, 江苏大学附属医院消化科 江苏省镇江市 212001
王文兵, 江苏大学生命科学院 江苏省镇江市 212001
基金项目: 江苏省科学技术厅社会发展项目, No. BS2002023.
通讯作者: 张尤历, 212001, 江苏省镇江市解放路438号, 江苏大学附属医院消化科. zjyouli@yahoo.com.cn
电话: 0511-5011787
收稿日期: 2006-09-28
修回日期: 2007-01-01
接受日期: 2007-01-04
在线出版日期: 2007-03-08
Abstract

目的: 比较不同地区H. pylori cagA 3'端可变区序列差异及序列的地域特征, 分析差异与疾病的相关性.

方法: 选择本实验室所收集的20例cagA+的PCR产物进行测序, 并通过ExPASy-Translation软件推测其氨基酸序列, 搜索并收集GenBank中已公布的不同地区3-6个H. pylori cagA 3'端可变区序列及其氨基酸序列进行比较分析.

结果: cagA蛋白的氨基酸序列可分为具有明显地域特征的东亚型和西方型两类; 部分东亚型菌株表现出西方型变异. 87.4%的菌株具有3个串联排列的EPIYA基序, 8.2%的菌株具有4个或以上EPIYA 基序. 新发现1条具有区域特征的含有3个氨基酸的序列. cagA蛋白氨基酸序列中的EPIYA数目与临床结果没有相关性.

结论: H. pylori cagA基因及其cagA蛋白序列具有明显多态性, 可以根据H. pylori cagA 3'端可变区的主要序列差异进行地域分型, cagA 3'端可变区的EPIYA基序的数目与临床结果没有相关性.

Keywords: 幽门螺杆菌; 细胞毒性相关基因A; EPIYA基序; 差异