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世界华人消化杂志. 2007-11-18; 15(32): 3377-3384
Published online 2007-11-18. doi: 10.11569/wcjd.v15.i32.3377
Published online 2007-11-18. doi: 10.11569/wcjd.v15.i32.3377
应用基因芯片技术筛选肝硬化相关基因
黄东凤, 黄介飞, 张弘, 黄晓平, 鲍柏军, 魏群, 华婷琰, 南通大学附属医院消化内科 江苏省南通市 226001
黄东凤, 硕士研究生, 主要从事消化系肿瘤基础及临床研究.
基金项目: 江苏省卫生厅医学科研资助项目, No. H200330.
通讯作者: 黄介飞, 226001, 江苏省南通市西寺路20号, 南通大学附属医院消化内科. jiefeihuang@163.com
电话: 0513-85806629 传真: 0513-85519820
收稿日期: 2007-04-10
修回日期: 2007-10-23
接受日期: 2007-10-28
在线出版日期: 2007-11-18
修回日期: 2007-10-23
接受日期: 2007-10-28
在线出版日期: 2007-11-18
Abstract
目的: 观探讨基因表达谱芯片技术在筛查肝硬化相关基因群表达中的作用.
方法: 按TRIzol法抽提肝硬化及正常肝脏组织总RNA, 分离纯化两种组织的mRNA. 经逆转录合成掺入生物素标记的cDNA合成探针, 与基因芯片(涵盖18 400个转录本, 代表14 500个明晰的基因)杂交, 扫描芯片荧光信号图像, 计算机分析, 比较二种组织基因表达谱差异.
结果: 2例肝硬化组织与正常肝脏组织相比, 有1424条基因(9.82%)共同表达差异, 其中共同上调基因980条和共同下调基因444条. 对1424条共同差异表达基因作了初步功能分类, 这些基因与肝硬化的发病机制存在相关性.
结论: 基因表达谱芯片技术可以筛选出肝硬化表达异常的相关基因群, 对其进一步研究有助于认识肝硬化的发病机制.
Keywords: 基因芯片; 肝硬化; 基因表达谱