临床经验
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世界华人消化杂志. 2007-10-18; 15(29): 3147-3151
Published online 2007-10-18. doi: 10.11569/wcjd.v15.i29.3147
镇江地区H. pylori的cagA基因及其3'可变区结构的变化
吴莺, 张尤历, 范钰, 魏金文, 何亚龙, 沈琰, 陈劲频, 印亦萍, 王文兵
吴莺, 张尤历, 范钰, 魏金文, 何亚龙, 沈琰, 陈劲频, 印亦萍, 江苏大学附属医院消化科 江苏省镇江市 212001
王文兵, 江苏大学生命科学院 江苏省镇江市 212000
基金项目: 江苏省科学技术厅社会发展基金资助项目, No. BS2006041.
通讯作者: 张尤历, 212001, 江苏省镇江市解放路438号, 江苏大学附属医院消化科. jszjwy@hotmail.com
电话: 0511-85026370
收稿日期: 2007-05-31
修回日期: 2007-09-18
接受日期: 2007-09-28
在线出版日期: 2007-10-18
Abstract

目的: 评估镇江地区H pylori临床株的cagA基因阳性率、了解菌株CagA蛋白的可能分型、 其羧端可变区EPIYA的数目以及与临床结果之间有无关联.

方法: 培养分离来自临床胃十二指肠疾病患者的H. pylori, 提取基因组DNA, 通过PCR方法检测H. pylori cagA基因的状况. 随机选择不同病种的cagA基因阳性(cagA+)的PCR产物, 通过转化质粒, 进行cagA+ PCR产物测序, 通过ExPASY-Tranlation软件获得cagA基因相应的CagA蛋白的氨基酸序列. 国际标准株NCTC11637的cagA基因以及CagA蛋白序列通过搜索NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)数据库获得.

结果: 60株H. pylori临床株中, 56例为cagA+, 阳性率达93.3%. 20例测序的结果表明, CagA蛋白结构可分为2种类型, 19株东亚型和1株西方型. 所有19株东亚型均为Yamaoka分型的A型, 所有20例菌株的EPIYA的数目均为3个, 与临床结果无关联.

结论: cagA基因阳性率在不同病种之间无差异. 镇江地区H. pylori临床株的CagA蛋白的一级结构, 与日本、韩国菌株一样, 主要为东亚型, 其CagA蛋白羧端可变区EPIYA数目均为3个, 与临床结果无关联.

Keywords: 幽门螺杆菌; cagA基因; CagA蛋白; EPIYA; 临床结果