临床研究
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世界华人消化杂志. 2007-08-18; 15(23): 2496-2502
Published online 2007-08-18. doi: 10.11569/wcjd.v15.i23.2496
北京地区乙肝病毒S基因序列多态性及其分布
王继荣, 周莉, 赵洪斌, 季芬, 丁惠国, 曾长青
王继荣, 赵洪斌, 季芬, 中国科学院北京基因组研究所 北京市 101300; 中国科学院研究生院 北京市 100049
曾长青, 中国科学院北京基因组研究所 北京市 101300
周莉, 丁惠国, 首都医科大学附属北京佑安医院消化科 北京市 100069
王继荣, 2005年内蒙古大学生命科学学院毕业, 2005至今中国科学院研究生院硕士研究生, 主要从事乙型肝炎病毒基因组突变及其临床关系研究.
基金项目: 中国科学院知识创新工程重大项目, No. KSCX2-SW-207; 北京市教育委员会基金项目, No. KM20070025024.
通讯作者: 曾长青, 101300, 北京市北京顺义空港工业区B区6号楼, 中国科学院北京基因组研究所. czeng@genomics.org.cn
电话: 010-80481146传真: 010-80498676
收稿日期: 2007-07-12
修回日期: 2007-08-12
接受日期: 2007-08-28
在线出版日期: 2007-08-18
Abstract

目的: 探讨HBV的S基因序列多态性、基因型/ 血清型在北京地区的分布特征以及基因型/血清型与临床症状的可能相关性.

方法: 对69例样品进行S区聚合酶链反应扩增测序, 通过标准序列使用MEGA3.1和DnaSP软件分析核苷酸差异度, 比较基因型、血清亚型的核酸及蛋白质差异.

结果: 在69例北京地区样品中检测出C基因型55例(79.7%), B基因型14例(20.3%); adrq+和adw2分别为52和14例, 2例血清亚型未见报道. S基因核苷酸差异度分布不均匀, 在C型中较高. 非同义突变类型多分布在疏水区中, 亲水区多为同义突变. 临床症状在B, C基因型中有显著性差异.

结论: S基因的序列差异在C型中高于B型; DNA序列突变在S基因中呈非随机分布, 疏水区突变率高而两个亲水区比较保守.

Keywords: 乙型肝炎病毒; S基因; 多态性; 基因型; 血清型; 聚合酶链反应