基础研究
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世界华人消化杂志. 2007-07-18; 15(20): 2186-2193
Published online 2007-07-18. doi: 10.11569/wcjd.v15.i20.2186
CEBPs及其调节的基因与大鼠肝再生相关性分析
王望, 陈晓光, 徐存拴
王望, 徐存拴, 河南师范大学生命科学学院 河南省新乡市 453007
陈晓光, 河南省科技部共建细胞分化调控重点实验室 河南省新乡市 453007
王望, 河南师范大学生命科学学院细胞生物学专业在读硕士研究生, 主要从事肝再生分子机制的研究.
通讯作者: 徐存拴, 453007, 河南省新乡市建设东路46号, 河南师范大学生命科学学院. xucs@x263.net
电话: 0373-3326001
收稿日期: 2007-04-24
修回日期: 2007-05-01
接受日期: 2007-05-10
在线出版日期: 2007-07-18
Abstract

目的: 探讨基因转录水平CCAAT增强子结合蛋白(CEBPs)及其调节基因在肝再生(LR)中的作用.

方法: 将与肝再生相关的CEBPs家族转录因子输入NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)和RGD(rgd.mcw.edu)等网站查找与其转录功能相关的文献, 从中得出大鼠、小鼠和人的CEBPs家族下游基因. 然后将人和小鼠基因与大鼠比对, 筛选出与大鼠不重复的人和小鼠基因. 再将他们与Rat Genome 230 2.0芯片的检测结果进行比对确认, 把其中表达上调或下调2倍以上的基因视为有意义变化的大鼠同源基因. 用Rat Genome 230 2.0 芯片检测他们在大鼠再生肝中的表达情况, 用真、假手术比较方法确定肝再生相关基因.

结果: 27个基因与肝再生相关, 其中11个基因表达上调, 6个基因表达下调, 10个基因在有的时点表达上调, 有的时点表达下调(简称上/下调表达). 他们的上调范围为对照的2-128倍, 下调范围为对照的2-16倍. 肝再生启动[部分肝切除(PH)后0.5-4 h]、G0/G1过渡(PH后4-6 h)、细胞增殖(PH后6-66 h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72-168 h)等4个阶段起始表达的基因数分别为18, 3, 8和1; 基因的总表达次数分别为18, 11, 25和16. 表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达, 在不同阶段发挥作用. 他们共表达上调126次, 下调76次. 表明肝再生中表达上调基因多于表达下调基因.

结论: CEBPs及其调节的基因与肝再生中细胞增殖、细胞分化、细胞凋亡、炎症反应、应激反应、脂类代谢和细胞外基质变化等密切相关.

Keywords: 部分肝切除; 大鼠基因组230 2.0芯片; CCAAT增强子结合蛋白; 肝再生相关基因