基础研究
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世界华人消化杂志. 2006-02-28; 14(6): 576-580
Published online 2006-02-28. doi: 10.11569/wcjd.v14.i6.576
HCV p7蛋白反式调节新基因3及其剪切体克隆化和生物信息学分析
陶明亮, 成军, 王春花, 郭江, 袁菊, 靳亚平, 毛羽
陶明亮, 成军, 王春花, 郭江, 袁菊, 毛羽, 北京地坛医院传染病研究所 北京市 100011
靳亚平, 西北农林科技大学动物科技学院 陕西省杨陵区 712100
陶明亮, 西北农林科技大学2004级硕士生, 主要从事动物生殖免疫学的研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 30371288; 国家重点基础研究973项目, No. 2004CB518908.
通讯作者: 成军, 100011, 北京市东城区安外大街地坛公园13号, 北京地坛医院传染病研究所. cj@genetherapy.com.cn
电话: 010-64481639 传真: 010-6428154
收稿日期: 2005-12-09
修回日期: 2006-01-09
接受日期: 2006-01-14
在线出版日期: 2006-02-28
Abstract

目的: 筛选HCV p7病毒蛋白反式调节的新靶基因p7TP3, 克隆p7TP3基因及其不同剪切体基因序列, 并进行功能分析, 探讨丙型肝炎病毒(HCV)p7病毒蛋白在HCV致病过程中的作用.

方法: 依据我们构建的真核表达载体pcDNA 3.1(-)-p7转染肝母细胞瘤细胞系HepG2, 提取总RNA, 逆转录为cDNA后进行基因表达谱芯片分析, 利用生物信息学技术获得新基因p7TP3及其可变剪切体的编码序列, 设计特异性引物, 并对其进行克隆化研究.

结果: 经测序鉴定获得新基因p7TP3的编码序列, 并发现了p7TP3的不同剪切体, 对p7TP3基因组进行分析, 获得剪切体的编码序列, 并进行了克隆化研究及生物信息学分析. p7TP3(416 bp)编码蛋白质序列比p7TP3(477 bp)少TQNTDVYPGLAVFFQNALIFFSTLIY 26个氨基酸残基, 其余序列相同.

结论: HCV p7蛋白是一种典型的病毒基因组编码的具有反式调节作用的蛋白. 利用分子生物学技术与生物信息学分析, 发现并鉴定了HCV p7TP3反式调节作用的新的靶基因p7TP3及其剪切体, 为阐明HCV p7蛋白的反式调节作用及其机制开辟了新的研究方向.

Keywords: 丙型肝炎病毒; 剪切体; p7蛋白