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世界华人消化杂志. 2005-07-15; 13(13): 1544-1549
Published online 2005-07-15. doi: 10.11569/wcjd.v13.i13.1544
Published online 2005-07-15. doi: 10.11569/wcjd.v13.i13.1544
大鼠CCl4所致肝纤维化自发逆转的基因表达谱研究
潘勤, 谢渭芬, 张忠兵, 中国人民解放军第二军医大学附属长征医院消化内科 上海市 200003
张新, 韩泽广, 国家人类基因组南方研究中心 上海市 201203
潘勤, 男, 1971-03-12生, 上海市人, 汉族. 2003年上海第二医科大学博士, 2005年中国人民解放军第二军医大学附属长征医院博士后, 主要研究肝纤维化的发生机制及药物防治.
基金项目: 中国博士后科学基金资助项目 , No. 2004036325 .
通讯作者: 潘勤, 200003, 上海市凤阳路415号, 中国人民解放军第二军医大学附属长征医院消化内科. fangchunhua@online.sh.cn
电话: 021-68452002 传真: 021-63520020
收稿日期: 2005-04-20
修回日期: 2005-04-28
接受日期: 2005-05-06
在线出版日期: 2005-07-15
修回日期: 2005-04-28
接受日期: 2005-05-06
在线出版日期: 2005-07-15
Abstract
目的: 利用cDNA微阵列杂交筛选肝纤维化自发逆转过程中的差异表达基因, 从而揭示纤维化逆转的基因表达谱.
方法: 通过四氯化碳(carbon tetrachloride, CCl4)注射SD大鼠8 wk, 随后停药6 wk建立肝纤维化自发逆转的动物模型.提取纤维化逆转过程中不同时间段的肝组织mRNA, 与cDNA微阵列杂交, 筛选表达水平明显上调或下调的差异基因, 并结合Cluster分析等进行分类.此外选择α共核蛋白、A-raf、早老素2及β 肌动蛋白作RT-PCR以验证检测结果.
结果: CCl4诱导的肝纤维化在停止毒剂注射后出现进行性消退.cDNA微阵列杂交证实, 肝纤维化消退过程中共有254条基因出现转录水平改变, 占基因总数的21.59%.其中8, 10, 12, 14 wk的差异表达基因分别为54, 85, 97, 132条.筛选所得的肝纤维化逆转相关基因主要涉及代谢相关酶、脂肪代谢相关蛋白、离子通道、转录因子、胃肠激素及受体、MAPK及PI3k/Akt信号转导通路等.RT-PCR检测与cDNA微阵列杂交一致, 证实了结果的可靠性.
结论: 肝纤维化逆转过程中基因表达谱发生显著改变, 主要涉及代谢相关酶、转运蛋白/协同转运蛋白、胃肠激素及受体、脂蛋白/脂肪酸结合蛋白、转录因子/核因子、MAPK信号转导通路等6类基因.
Keywords: 基因芯片; 肝纤维化; 逆转