基础研究
Copyright ©The Author(s) 2005. Published by Baishideng Publishing Group Inc. All rights reserved.
世界华人消化杂志. 2005-06-15; 13(11): 1291-1294
Published online 2005-06-15. doi: 10.11569/wcjd.v13.i11.1291
荧光标记杂交双探针PCR融解曲线法在临床的应用评价
张淑云, 刘伟, 李迪, 谷鸿喜, 仰曙芬, 周志红, 杜博, 金茜, 常曼丽
张淑云, 刘伟, 仰曙芬, 周志红, 杜博, 金茜, 常曼丽, 哈尔滨医科大学附属第二医院科研实验中心 黑龙江省哈尔滨市 150086
李迪, 谷鸿喜, 哈尔滨医科大学微生物学教研室 黑龙江省哈尔滨市 150086
张淑云, 女, 1965-11-05生, 黑龙江省哈尔滨市人, 汉族. 1988年哈尔滨医科大学本科毕业, 1993年哈尔滨医科大学硕士毕业, 副主任医师, 副教授, 主要从事临床病毒学研究和临床基因诊断工作.
基金项目: 黑龙江省自然科学基金资助项目, No. D0307.
通讯作者: 张淑云, 150086, 黑龙江省哈尔滨市南岗区保健路247号, 哈尔滨医科大学附属第二医院科研实验中心. zhshuyun136@sina.com
电话: 013163682992 传真: 0451-86688011
收稿日期: 2005-03-01
修回日期: 2005-03-27
接受日期: 2005-04-01
在线出版日期: 2005-06-15
Abstract

目的: 对国产荧光标记杂交双探针PCR融解曲线法(FH-PCR-MC)检测乙型肝炎病毒聚合酶酪氨酸-蛋氨酸-天门冬氨酸-天门冬氨酸基序(HBV YMDD)变异的试剂进行临床应用评价.

方法: 慢性乙型肝炎患者外周血浆标本217份, 分别采用荧光标记Taqman探针定量PCR法(FT-PCR)和荧光标记杂交双探针PCR融解曲线法(FH-PCR-MC)检测HBV DNA含量和YMDD及其变异; 其中78份HBV DNA阳性标本采用基因型特异性多引物对巢式PCR法进行基因分型(A-F), 30份标本用PCR产物克隆测序法检测HBV YMDD及其变异.

结果: 血浆标本HBV DNA阳性率(≥1.0×106 copies/L)为75.6%(164/217).YMDD及其变异检出率为67.7%(147/217), 其中YMDD 44.9%(66/147), YIDD 22.5%(33/147), YVDD 17.7%(26/147), YIDD/YVDD混合株10.9%(16/147), 其他混合株4.0%(6/147); 结合HBV DNA含量, HBV YMDD及其变异的检出下限为HBV DNA = 5.0×106 copies/L, 但在106 copies/L时检出率较低, 仅为36.4%, 随着HBV DNA含量增高, 检出率显著增高(>80%), 且在107 copies/L时即有显著增高(χ2 = 7.177, P <0.01).在基因分型的78份标本中, C基因型占89.8%, B和D基因型分别占8.9%和1.3%, YMDD及其变异总检出率为100%,变异总检出率为59.0%; 1份D基因型YMDD及其变异检测为YIDD/YVDD混合变异; B, C两种基因型变异检出率分别为71.4%和55.7%, 但二者无统计学差异.以测序法的检测结果为相对标准,则FH-PCR-MC法检测HBV YMDD及其变异的相对敏感性、特异性和符合率分别为96.3%(26/27), 100%(3/3)和96.7%(29/30); 对于HBV YMDD及其变异的类型, 两种方法检测结果一致.

结论: FH-PCR-MC法是一种快速、特异的HBV YMDD及其变异检测方法, 具有较高的检出率, 且能区分YMDD及其变异的类型.

Keywords: 荧光标记; 杂交双探针; 多聚酶连反应; 融解曲线法; 乙型肝炎病毒YMDD