病毒性肝炎
Copyright ©The Author(s) 2004. Published by Baishideng Publishing Group Inc. All rights reserved.
世界华人消化杂志. 2004-03-15; 12(3): 604-606
Published online 2004-03-15. doi: 10.11569/wcjd.v12.i3.604
SEN病毒核酸异质性及准种现象的观察
唐蔚, 彭晓谋, 杨山麦, 王召钦, 王辉, 蒋晓玲, 周伯平
唐蔚, 杨山麦, 王召钦, 王辉, 蒋晓玲, 周伯平, 深圳市肝病研究所, 深圳市东湖医院 广东省深圳市 518020
彭晓谋, 中山大学附属第三医院传染病科 广东省广州市 510630
唐蔚, 女, 1970-01-25生, 上海市人, 汉族. 1993年复旦大学医学院(原上海医科大学)本科毕业, 2003-06中山大学广州北校区硕士研究生毕业, 主治医师. 主要从事传染病的临床和科研工作. 发表论文7篇.
通讯作者: 唐蔚, 518020, 广东省深圳市布心路2019号, 深圳市肝病研究所, 深圳市东湖医院. viviantwei@hotmail.com
电话: 0755-25509800-3301 传真: 0755-25604034
收稿日期: 2003-06-10
修回日期: 2003-07-25
接受日期: 2003-11-13
在线出版日期: 2004-03-15
Abstract

目的: 报告SEN病毒核苷酸的异质性和准种特点.

方法: 取深圳地区SEN病毒流行病学调查得到的SENV D型或H型阳性血清各3份进行巢式PCR扩增, 阳性PCR产物克隆至T载体, 每份随机挑选1-11份阳性克隆进行分别测序, 并与GeneBank上的北京株、美国株、意大利株和日本株进行比较分析.

结果: 挑选的16株克隆中D型和H型分别为13株和3株, 均属于SENV序列. 来自SZ-54的11株SENV D型克隆中准种占81.8%(9/11). 本地3例患者的11株SENV D型阳性克隆与GeneBank的4株异地株, 共15株间的同源性为77.7%-99.5%. 同一宿主9个克隆间的碱基变异个数为8.5±5.2, 与同一地区不同宿主的11个克隆间的28.9±3.2和不同地区不同宿主的15个克隆间的29.6±7.8比较, 有显著性差异(P均<0.001). 3株SENV H型阳性克隆与GeneBank的4株异地株共7株间的同源性为74.6%-95.0%. 进化分析表明, 来自同一宿主的分离株遗传关系最近, 同地区不同宿主的分离株其次, 与4株异地分离株的遗传距离较远.

结论: SENV核酸的变异性高, 个体间存在较大差异, 且在同一个感染者体内也存在大量SENV准种. 在检测SENV的方法选择、比较SENV的序列差异和分析SENV的临床意义时应充分考虑到SENV的这种特性.

Keywords: N/A