病毒性肝炎
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世界华人消化杂志. 2004-02-15; 12(2): 311-314
Published online 2004-02-15. doi: 10.11569/wcjd.v12.i2.311
基因表达谱芯片技术筛选NS5A-TP4蛋白反式调节基因
杨倩, 成军, 刘妍, 王建军, 洪源, 张树林
杨倩, 成军, 刘妍, 王建军, 洪源, 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心、全军病毒性肝炎防治研究重点实验室 北京市 100039
张树林, 西安交通大学第一医院传染科 陕西省西安市 710061
杨倩, 女, 1970-11-06, 广西桂平人, 汉族. 1994年西安医科大学本科毕业, 1999年西安医科大学硕士毕业, 目前为西安交通大学第一医院博士研究生, 主要从事传染病临床与基础研究工作.
基金项目: 国家自然科学基金攻关项目, No. C03011402, No. C30070689, 军队"九、五"科技攻关项目, No. 98D063, 军队回国留学人员启动基金项目, No. 98H038, 军队"十、五"科技攻关青年基金项目, No. 01Q138, 军队"十、五"科技攻关面上项目, No. 01MB135.
通讯作者: 成军, 100039, 北京市西四环中路100号, 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心, 全军病毒性肝炎防治研究重点实验室. cj@genetherapy.com.cn
电话: 010-66933391 传真: 010-63801283
收稿日期: 2003-07-12
修回日期: 2003-08-10
接受日期: 2003-08-16
在线出版日期: 2004-02-15
Abstract

目的: 对新基因NS5A-TP4转染肝癌细胞的基因表达谱进行分析, 探索该基因表达对肝细胞基因表达的调节机制及其生物学功能.

方法: 应用生物信息学(bioinformatics)技术, 分析我室通过抑制性消减杂交技术筛选得到的新基因NS5A-TP4的全长编码序列, 并NS5A-TP4构建基因的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5A-TP4. 应用基因表达谱芯片技术对重组表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5A-TP4转染的HepG2细胞和空载体处理的相同细胞差异表达的mRNA进行检测.

结果: 确定基因NS5A-TP4由762 nt组成, 编码253 aa的蛋白. 基因表达谱芯片所检测的1152条目的基因均为GenBank中登录的基因, NS5A-TP4表达质粒转染的细胞有18条差异表达基因, 其中12条基因表达增强, 6条基因表达降低. 这些差异表达的基因与细胞信号转导、凋亡、生长调节密切相关.

结论: 基因表达谱芯片技术可为初步探索新基因的功能提供重要的资料. 本实验结果为进一步阐明NS5A-TP4生物学功能及HCV-NS5A的致病机制提供了理论依据.

Keywords: N/A