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基因芯片技术检测HBV HCV及HBV YMDD变异株
李刚, 舒欣, 马会慧, 陈伟, 陈文思, 陈青, 江元森, 姚集鲁, 中山大学附属第三医院传染病科 广东省广州市 510630
李刚, 男, 1964-03-11生, 广东省梅州市人, 汉族, 传染病学教授, 主任医师, 硕士生导师. 1987年中山医科大学毕业, 1995年获得博士学位, 1998年到英国进修1年. 现从事病毒性传染病的研究.
基金项目: 广东省科技攻关项目资助 , No. 2km05302s .
通讯作者: 李刚, 510630, 广东省广州市石牌岗顶, 中山大学附属第三医院传染病科. ligangzh@public.guangzhou.gd.cn
电话: 020-87544614
收稿日期: 2002-07-20
修回日期: 2002-08-01
接受日期: 2002-08-09
在线出版日期: 2003-02-15
修回日期: 2002-08-01
接受日期: 2002-08-09
在线出版日期: 2003-02-15
Abstract
目的: 探讨基因芯片技术在乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)及HBV YMDD变异株检测中的应用.
方法: 采用HBV、HCV联合基因芯片检测40份血清标本, 并与HBV, HCV基因定量检测方法比较; 采用HBV YMDD变异株芯片检测20份血清标本, 并与错配PCR及DNA序列测定方法比较.
结果: HBV, HCV联合基因芯片与HBV DNA定量检测的符合率为85%(34/40), HBV检出率为83%(19/23), 假阳性率为12%(2/17); 与HCV RNA定量检测的符合率为85%(34/40), HCV检出率为58%(7/12), 假阳性率为4%(1/28). HBV YMDD变异株芯片与本室设计的错配PCR符合率为70%(14/20), 5份芯片检测的标本与DNA序列测定结果-致, 该芯片尚可检测出不同病毒体或变异体的混合感染.
结论: HBV, HCV联合基因芯片对HBV的检测有较高的敏感性, 但存在-定程度的非特异性; 对HCV的检测敏感性偏低, 但特异性较高. HBV YMDD变异株芯片敏感性和特异性均较高, 同时能检测出病毒变异体的共生现象.
Keywords: N/A