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世界华人消化杂志. 2003-10-15; 11(10): 1470-1474
Published online 2003-10-15. doi: 10.11569/wcjd.v11.i10.1470
Published online 2003-10-15. doi: 10.11569/wcjd.v11.i10.1470
幽门螺杆菌黏附素基因babA2的克隆、序列测定及其生物信息学分析
白杨, 黄文, 王继德, 周殿元, 张亚历, 中国人民解放军第一军医大学南方医院全军消化病研究所 广东省广州市 510515
白杨, 男, 1973年生, 山西省太原人, 汉族, 2002年毕业于第一军医大学, 医学博士, 主治医师, 讲师. 主要从事消化系统疾病的研究.
张兆山, 军事医学科学院生物工程研究所 北京市 100071
基金项目: "863"计划专题 , No. 102-07-03-06 ; 国家自然科学基金 , No. 30170890, 30270078 ; 军队"十五"医药卫生科研课题 , No. OIMA-132 .
通讯作者: 张亚历, 100071, 广东省广州市广州大道北路1838号, 中国人民解放军第一军医大学南方医院全军消化病研究所. zhangyl@fimmu.edu.cn
电话: 020-61641531
收稿日期: 2002-10-29
修回日期: 2002-11-20
接受日期: 2002-11-25
在线出版日期: 2003-10-15
修回日期: 2002-11-20
接受日期: 2002-11-25
在线出版日期: 2003-10-15
Abstract
目的
获取幽门螺杆菌黏附素基因babA2, 并将他克隆到质粒pET-22b(+)中进行核苷酸序列分析, 并对其进行生物信息学分析, 为研究Hp黏附素的分子机制和免疫原性提供基础.
方法
利用PCR技术扩增babA2, 并将其定向插入pET-22b(+)载体, 通过DNA序列分析仪进行核苷酸分析, 生物信息学软件对其进行生物学特性分析.
结果
DNA序列分析表明, 所克隆的babA2基因序列与GenBank公布的一致. ANTHEPROT V4.3c软件预测其蛋白质分子量约为78 KD, 并显示出了良好的抗原性和疏水性.
结论
本研究获得了序列正确的babA2基因, 生物信息学分析表明其具有优良的免疫原性, 为其重组表达及其相关研究奠定了良好的基础.
Keywords: N/A