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基因芯片法筛选萎缩性胃炎相关的差异表达基因
徐俊荣, 张沥, 张玲霞, 贾长河, 张宁霞, 江梅, 曹广周, 西安市中心医院消化内科 陕西省西安市 710003
崔大祥, 中国人民解放军第四军医大学基因诊断技术研究所 陕西省西安市 710033
徐俊荣, 女, 1970-02-15生, 陕西省西安市人, 汉族.1993年西安医科大学临床医学系本科毕业, 2001年第四军医大学研究生课程班毕业. 硕士, 主治医师, 主要从事幽门螺杆菌及消化系疾病研究, 发表论文7篇.
通讯作者: 徐俊荣, 710003, 陕西省西安市后宰门2号, 西安市中心医院消化内科. xujunrong@netease.com
电话: 029-7582637
收稿日期: 2002-07-08
修回日期: 2002-07-10
接受日期: 2002-07-22
在线出版日期: 2003-01-15
修回日期: 2002-07-10
接受日期: 2002-07-22
在线出版日期: 2003-01-15
Abstract
目的: 建立大鼠萎缩性胃炎模型, 用高密度基因芯片筛选萎缩性胃炎相关的差异表达基因.
方法: 采用热盐水、盐水、热水灌胃的方法建立大鼠萎缩性胃炎模型, 并设立正常对照组、正常喂养组作为对照. 提取标本的总RNA, 定量后并反转录成cDNA, 萎缩性胃炎标本标记上Cy5, 正常对照标本标记上Cy3, 与含有8248个大鼠基因的cDNA芯片进行杂交, 常规洗片, 扫描, 分析杂交结果.
结果: 热盐水组灌胃12 wk的大鼠经病理诊断已存在萎缩性胃炎的特征, 盐水、热水组灌胃的大鼠在24 wk时经病理诊断也存在萎缩性胃炎的特征; 热盐水组与正常对照组之间的差异基因共有436个, 145个基因在萎缩性病变组织中呈高表达, 291个基因在正常组织中呈高表达; 热水组与正常对照组之间的差异表达基因共有398个, 98个基因在萎缩性病变组织中呈高表达, 300个基因在正常组织中呈高表达; 热盐水组与盐水组之间差异表达基因共有36个, 其中23个在热盐水组中呈高表达, 13个基因在盐水对照组中呈高表达.
结论: 成功地建立了大鼠萎缩性胃炎的模型; 筛选出了与热盐水、盐水、热水诱发的萎缩性胃炎发生有关的差异表达基因.
Keywords: N/A