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©The Author(s) 2014.
世界华人消化杂志. 2014-10-28; 22(30): 4578-4587
在线出版 2014-10-28. doi: 10.11569/wcjd.v22.i30.4578
在线出版 2014-10-28. doi: 10.11569/wcjd.v22.i30.4578
表1 结直肠癌组织标本临床资料
临床资料 | 基因芯片用标本 | RT-PCR用标本 |
n | 11 | 53 |
性别 | ||
男 | 5 | 29 |
女 | 6 | 24 |
年龄(岁) | ||
中位(范围) | 57(47-82) | 61(41-83) |
病理分级 | ||
高 | 2 | 23 |
中 | 8 | 12 |
低 | 1 | 18 |
临床分期 | ||
Ⅰ-Ⅱ | 3 | 26 |
Ⅲ-Ⅳ | 8 | 27 |
淋巴转移 | ||
有 | 7 | 31 |
无 | 4 | 22 |
远处转移 | ||
有 | 1 | 11 |
无 | 10 | 42 |
部位 | ||
结肠 | 2 | 20 |
直肠 | 9 | 33 |
表2 miRNAs引物序列
基因名称 | 引物 | 序列 5'-3' | |
hsa-miR-31 | RT-Primer | GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGG | |
TATTCGCACTGGATACGACAGCTAT | |||
PCR-Primer | Forward Primer | AGGCAAGATGCTGGCATAGCT | |
Reverse Primer | CAAGGCAAGATGCTGGCATA | ||
hsa-miR-105 | RT-Primer | GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGG | |
TATTCGCACTGGATACGACACAGGA | |||
PCR-Primer | Forward Primer | TCAAATGCTCAGACTCCTGT | |
Reverse Primer | GCGTCAAATGCTCAGACTCC | ||
hsa-miR-196b | RT-Primer | GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGG | |
TATTCGCACTGGATACGACGAAGGC | |||
PCR-Primer | Forward Primer | TCGACAGCACGACACTGCCTTC | |
Reverse Primer | TCGACAGCACGACACTGCC | ||
U6 | RT-Primer | AACGCTTCACGAATTTGCGT | |
PCR-Primer | Forward Primer | CTCGCTTCGGCAGCACA | |
Reverse Primer | GTGCAGGGTCCGAGGT |
表3 结直肠癌中明显表达上调的miRNAs
miRNA | log2Ratio |
hsa-miR-31 | 21.0559 |
hsa-miR-767-5p | 13.9791 |
hsa-miR-105 | 11.7936 |
hsa-miR-196b | 9.288 |
hsa-miR-224 | 9.1227 |
hsa-miR-483-5p | 9.0639 |
hsa-miR-1246 | 7.6698 |
hsa-miR-196b | 6.815 |
hsa-miR-663b | 6.5095 |
hsa-miR-141 | 6.1256 |
hsa-miR-584 | 5.6565 |
hsa-miR-18a | 5.65 |
hsa-miR-19a | 5.3913 |
hsa-miR-452 | 5.2654 |
hsa-miR-622 | 5.2073 |
表4 结直肠癌中明显表达下调的miRNAs
miRNA | log2Ratio |
hsa-miR-215 | -15.87301587 |
hsa-miR-4298 | -6.075334143 |
hsa-miR-139-5p | -6.042296073 |
hsa-miR-490-5p | -5.586592179 |
hsa-miR-3201 | -4.518752824 |
hsa-miR-363 | -3.976143141 |
hsa-miR-187 | -3.755163335 |
hsa-miR-133a | -3.946329913 |
hsa-miR-1825 | -3.6900369 |
hsa-miR-30a | -3.584229391 |
表5 CRC患者miR-31、miR-105、miR-196b表达与临床病理之间的关系 [M(Q4)]
分组 | n | miR-31 | miR-105 | miR-196b |
结直肠癌组织 | 53 | 18.40(14.8)b | 30.56(16.08)b | 19.38(12.42)b |
癌旁正常组织 | 15 | 5.73(3.21) | 6.62(4.12) | 4.20(2.51) |
病理分级 | ||||
高 | 23 | 10.32(11.86)d | 19.35(7.16)c | 11.32(3.31)c |
中 | 12 | 11.20(4.84)c | 22.30(9.73)c | 12.30(4.42)c |
低 | 18 | 20.83(6.8) | 32.04(4.22) | 22.07(4.3) |
淋巴结转移 | ||||
阴性 | 22 | 15.21(8.86) | 18.66(3.4) | 15.02(7.62) |
阳性 | 31 | 17.05(9.79) | 32.03(7.14)f | 19.10(7.69) |
远处转移 | ||||
无 | 42 | 13.02(8.01) | 19.23(2.3) | 14.90(6.63) |
有 | 11 | 17.23(13.79) | 30.07(11.99)h | 18.93(9.73) |
临床分期 | ||||
Ⅰ | 11 | 10.07(7.81) | 17.02(4.38) | 13.16(4.82) |
Ⅱ | 15 | 13.23(7.01) | 18.52(5.08) | 12.05(4.93) |
Ⅲ | 16 | 18.06(9.74)i | 25.37(5.17)i | 17.83(7.78) |
Ⅳ | 11 | 17.23(5.96)i | 32.20(13.87)j | 19.42(11.73) |
引文著录: 张媛, 林贞花, 金铁峰, 金仁顺. 结直肠癌中miRNAs差异表达谱的筛查. 世界华人消化杂志 2014; 22(30): 4578-4587