新疆哈萨克族胃癌中Smad4基因启动子的甲基化状态

表1 Smad4甲基化引物序列

基因	引物序列	扩增片段长度
SMAD4-F	aggaagagagAGTTTAGGGGAGAGTAGGAAGGGT	320 bp
SMAD4-R	cagtaatacgactcactatagggagaaggctAAACCCAAATCCAAATTCAAAAC

表2 哈族胃癌和哈族正常组织12组Smad4基因CpG片段的甲基化率

分组	CpG片段	哈族胃癌组	哈族正常组
1	Smad4-1_2_CpG_1	0.01030303	0.00378378
2	Smad4-1_2_CpG_3.4	0.01918919	0.01090909
3	Smad4-1_2_CpG_6	0.01181818	0.01594595
4	Smad4-1_2_CpG_7.8	0.03333333	0.01945946
5	Smad4-1_2_CpG_10.11	0.02033748	0.01152850
6	Smad4-1_2_CpG_14	0.07181818	0.06729730
7	Smad4-1_2_CpG_15	0.01939394	0.02594595
8	Smad4-1_2_CpG_16.17.18.19	0.02696970	0.02648649
9	Smad4-1_2_CpG_20	0.00878788	0.00513514
10	Smad4-1_2_CpG_27.28	0.03606061	0.02702703
11	Smad4-1_2_CpG_29	0.00878788	0.00513514
12	Smad4-1_2_CpG_31.32.33	0.05121212	0.04216216
总甲基化率(%)		0.31801152	0.26081599
平均甲基化率(%)		0.02650096	0.02173467

表3 胃癌组织和正常组织的12个Smad4基因CpG片段的Wilcoxon W秩和检验值

序号	基因片段 Mann-Whitney U		Wilcoxon W	P值
1	Smad4-1_2_CpG_1	548.000	1251.000	0.317
2	Smad4-1_2_CpG_3.4	438.500	999.500	0.035
3	Smad4-1_2_CpG_6	544.000	1247.000	0.410
4	Smad4-1_2_CpG_7.8	487.000	1190.000	0.139
5	Smad4-1_2_CpG_10.11	438.500	999.500	0.035
6	Smad4-1_2_CpG_14	548.000	1251.000	0.452
7	Smad4-1_2_CpG_15	480.500	1041.500	0.118
8	Smad4-1_2_CpG_16.17.18.19	598.000	1159.000	0.881
9	Smad4-1_2_CpG_20	501.500	1204.500	0.158
10	Smad4-1_2_CpG_27.28	497.500	1200.500	0.175
11	Smad4-1_2_CpG_29	501.500	1204.500	0.158
12	Smad4-1_2_CpG_31.32.33	504.000	1207.000	0.198