基因芯片技术对结直肠癌相关基因SNPs位点的相关性分析

表1 病例组和对照组SNPs位点基因型频率比较 n(%)

基因位点	基因型	病例组	对照组	OR值	95%CI	P值
IL1β-01	T/T	7(35.0)	8(26.7)	1.00		>0.05
	T/G	5(25.0)	16(53.3)	2.00	0.52-7.70
	G/G	6(30.0)	6(20.0)	0.87	0.19-4.00
CYP19A1-09	T/T	15(75.0)	11(36.7)	1.00		<0.05
	T/C	4(20.0)	13(43.3)	4.43	1.13-17.34
	C/C	1(5.0)	6(20.0)	8.18	0.86-78.05
GSTP1-01	A/A	9(45.0)	17(56.7)	1.00		>0.05
	A/G	10(50.0)	9(30.0)	0.48	0.14-1.60
	G/G	1(5.0)	4(13.3)	2.12	0.20-21.89
IL4-01	T/T	9(45.0)	17(56.7)	1.00		>0.05
	T/C	8(40.0)	12(40.0)	0.79	0.24-2.65
	C/C	3(15.0)	1(3.3)	0.18	0.02-1.95
CYP19A1-14	T/T	6(30.0)	7(23.3)	1.00		>0.05
	T/C	10(50.0)	16(53.3)	1.37	0.36-5.27
	C/C	4(20.0)	7(23.3)	1.50	0.29-7.75
CYP19A1-01	G/G	7(35.0)	7(23.3)	1.00		>0.05
	A/G	10(50.0)	16(53.3)	1.60	0.43-5.94
	A/A	3(15.0)	7(23.3)	2.33	0.42-12.91
IL10-02	A/A	10(50.0)	10(33.3)	1.00		>0.05
	A/C	7(35.0)	18(60.0)	2.57	0.75-8.86
	C/C	3(15.0)	2(6.7)	0.67	0.09-4.89
SOD2-01	T/T	18(90.0)	25(83.3)	1.00		>0.05
	T/C	2 (10.0)	5(16.7)	1.80	0.31-10.34
IL10-03	A/A	17 (85.0)	20(66.7)	1.00		>0.05
	A/G	3(15.0)	9(30.0)	2.55	0.59-10.96
	G/G	0(0.0)	1(3.3)
CYP19A1-06	G/G	11 (55.0)	11(36.7)	1.00		>0.05
	T/G	8 (40.0)	13(43.3)	1.62	0.48-5.45
	T/T	1(5.0)	6(20.0)	6.00	0.62-58.43
MRTT-01	A/A	18(90.0)	16(53.3)	1.00		<0.05
	A/G	2(10.0)	13(43.3)	7.31	1.43-37.47
	G/G	0(0.0)	1(3.3)
TP53-01	C/C	7(35.0)	10(33.3)	1.00		>0.05
	G/C	11(55.0)	15(50.0)	0.95	0.28-3.30
	G/G	2(10.0)	5(16.7)	1.75	0.26-11.74

表2 病例组和对照组SNPs位点等位基因频率比较

基因位点	等位基因		病例组		对照组
	等位基因	%	n	%	n	%
IL1β-01	T	53	21	52	32	53
	C	47	19	48	28	47
CYP19A1-09	T	69	34	85	35	58
	C	31	6	15	25	42
GSTP1-01	A	71	28	70	43	72
	G	29	12	30	17	28
IL4-01	T	72	26	65	46	77
	C	28	14	35	14	23
CYP19A1-14	T	52	22	55	30	50
	C	48	18	45	30	50
CYP19A1-01	G	54	24	60	30	50
	A	46	16	40	30	50
IL10-02	A	65	27	68	38	63
	C	35	13	32	22	37
SOD2-01	T	93	38	95	55	92
	C	7	2	5	5	8
IL10-03	A	86	37	85	49	82
	G	14	3	15	11	18
CYP19A1-06	G	65	30	75	35	58
	T	35	10	25	25	42
MRTT-01	A	83	38	95	45	75
	G	17	2	5	15	25
TP53-01	C	60	25	62	35	58
	G	40	15	38	25	42